Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

PIP5K1A

phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 alpha

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
1q21.3
Koordinater
Kromosom 1: 151 198 552–151 249 531 (GRCh38)
Eksoner
16 eksoner over 51 kb
Protein
562 aminosyrer
MANE Select-transkripsjon
ENST00000368888.9NM_001135638.2
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser PIP5K1A ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er PIP5K1A bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 1, med en parentes der PIP5K1A står. PIP5K1A og 32 gener i nærheten på kromosom 1, fra 150 724 042 til 151 724 041.Kromosom 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44150,8 Mb151 Mb151,2 Mb151,4 Mb151,6 MbCTSS: 150 730 079–150 765 957, bakover-strengCTSSCTSK: 150 794 880–150 809 577, bakover-strengCTSKARNT: 150 808 617–150 876 771, bakover-strengARNTCTXND2: 150 887 136–150 913 292, fremover-strengCTXND2SETDB1: 150 926 263–150 964 748, fremover-strengSETDB1CERS2: 150 959 099–150 977 396, bakover-strengCERS2ANXA9: 150 981 321–150 996 077, fremover-strengANXA9MINDY1: 150 995 125–151 008 376, bakover-strengPRUNE1: 151 008 408–151 035 714, fremover-strengBNIPL: 151 036 321–151 047 720, fremover-strengC1orf56: 151 047 746–151 051 986, fremover-strengC1orf56CDC42SE1: 151 050 242–151 070 325, bakover-strengCDC42SE1MLLT11: 151 054 177–151 069 544, fremover-strengMLLT11GABPB2: 151 070 514–151 130 109, fremover-strengGABPB2SEMA6C: 151 131 685–151 147 813, bakover-strengTIPE2: 151 156 621–151 160 255, fremover-strengSCNM1: 151 156 664–151 179 006, fremover-strengSCNM1LYSMD1: 151 159 748–151 165 948, bakover-strengTMOD4: 151 169 984–151 176 284, bakover-strengTMOD4VPS72: 151 176 304–151 195 321, bakover-strengVPS72PIP5K1A: 151 198 552–151 249 531, fremover-strengPIP5K1APSMD4: 151 254 709–151 279 502, fremover-strengPSMD4ZNF687: 151 281 502–151 292 180, fremover-strengZNF687PI4KB: 151 291 792–151 328 394, bakover-strengPI4KBRFX5: 151 340 640–151 347 339, bakover-strengRFX5SELENBP1: 151 364 157–151 372 716, bakover-strengSELENBP1PSMB4: 151 399 556–151 401 941, fremover-strengPSMB4POGZ: 151 402 724–151 459 511, bakover-strengPOGZCGN: 151 510 139–151 538 692, fremover-strengCGNTUFT1: 151 540 305–151 583 583, fremover-strengTUFT1SNX27: 151 611 985–151 699 091, fremover-strengSNX27CELF3: 151 700 058–151 716 803, bakover-strengCELF3RIIAD1: 151 710 433–151 729 805, fremover-strengRIIAD1Diagram av PIP5K1A: 16 eksoner på fremover-strengen til kromosom 1Ekson 1: 151 198 552–151 199 081, 530 baserEkson 2: 151 224 245–151 224 279, 35 baserEkson 3: 151 224 371–151 224 406, 36 baserEkson 4: 151 227 320–151 227 400, 81 baserEkson 5: 151 231 671–151 231 801, 131 baserEkson 6: 151 232 248–151 232 365, 118 baserEkson 7: 151 232 551–151 232 703, 153 baserEkson 8: 151 234 197–151 234 496, 300 baserEkson 9: 151 236 558–151 236 763, 206 baserEkson 10: 151 238 182–151 238 265, 84 baserEkson 11: 151 239 130–151 239 178, 49 baserEkson 12: 151 239 955–151 240 039, 85 baserEkson 13: 151 242 123–151 242 269, 147 baserEkson 14: 151 242 438–151 242 567, 130 baserEkson 15: 151 246 920–151 246 965, 46 baserEkson 16: 151 247 863–151 249 531, 1 669 baser12468101214165′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 3,8 kb av genets 51 kb, og 1 689 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av PIP5K1A

31Moderat

Hvor vanskelig PIP5K1A er å sekvensere med korte leser, av 100

Noen av eksonene til PIP5K1A ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til PIP5K1A i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet4,9 %
  • Homologi44 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner3,5 %
  • GC-innhold0 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). PIP5K1A-genet: phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 alpha. Hentet 21. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pip5k1a

Vancouver

Dante Labs. PIP5K1A-genet: phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 alpha [Internett]. [sitert 21. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pip5k1a

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test