Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

CLPTM1

CLPTM1 regulator of GABA type A receptor forward trafficking

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
19q13.32
Koordinater
Kromosom 19: 44 955 380–44 993 341 (GRCh38)
Eksoner
14 eksoner over 38 kb
Protein
669 aminosyrer
MANE Select-transkripsjon
ENST00000337392.10NM_001294.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser CLPTM1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er CLPTM1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 19, med en parentes der CLPTM1 står. CLPTM1 og 33 gener i nærheten på kromosom 19, fra 44 474 361 til 45 474 360.Kromosom 1919q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4344,6 Mb44,8 Mb45 Mb45,2 Mb45,4 MbZNF180: 44 470 957–44 500 547, bakover-strengZNF180CEACAM20: 44 501 677–44 529 788, bakover-strengCEACAM20IGSF23: 44 613 563–44 636 787, fremover-strengIGSF23PVR: 44 643 798–44 666 162, fremover-strengPVRCEACAM19: 44 662 278–44 684 370, fremover-strengCEACAM19CEACAM16: 44 699 151–44 710 718, fremover-strengCEACAM16BCL3: 44 747 705–44 760 044, fremover-strengBCL3CBLC: 44 777 845–44 802 301, fremover-strengCBLCBCAM: 44 809 040–44 821 421, fremover-strengBCAMNECTIN2: 44 846 175–44 890 134, fremover-strengNECTIN2TOMM40: 44 890 569–44 903 695, fremover-strengAPOE: 44 903 787–44 909 396, fremover-strengAPOC1: 44 913 133–44 920 054, fremover-strengAPOC1APOC2: 44 936 126–44 949 585, fremover-strengAPOC2APOC4: 44 942 234–44 945 496, fremover-strengAPOC4APOC4-APOC2: 44 942 238–44 949 565, fremover-strengAPOC4-APOC2CLPTM1: 44 955 380–44 993 341, fremover-strengCLPTM1RELB: 45 001 431–45 038 194, fremover-strengRELBCLASRP: 45 039 042–45 070 956, fremover-strengCLASRPZNF296: 45 071 500–45 076 485, bakover-strengZNF296GEMIN7: 45 075 575–45 091 518, fremover-strengGEMIN7MARK4: 45 079 288–45 305 284, fremover-strengPPP1R37: 45 091 396–45 148 077, fremover-strengPPP1R37NKPD1: 45 149 744–45 160 982, bakover-strengNKPD1BLOC1S3: 45 152 811–45 216 933, fremover-strengBLOC1S3TRAPPC6A: 45 162 928–45 178 268, bakover-strengTRAPPC6AEXOC3L2: 45 210 600–45 245 429, bakover-strengEXOC3L2CKM: 45 306 411–45 323 372, bakover-strengCKMKLC3: 45 333 434–45 351 537, fremover-strengKLC3ERCC2: 45 349 773–45 370 918, bakover-strengERCC2PPP1R13L: 45 379 634–45 406 367, bakover-strengPPP1R13LPOLR1G: 45 406 644–45 410 737, fremover-strengPOLR1GERCC1: 45 407 333–45 479 055, bakover-strengERCC1FOSB: 45 467 989–45 475 179, fremover-strengFOSBDiagram av CLPTM1: 14 eksoner på fremover-strengen til kromosom 19Ekson 1: 44 955 380–44 955 467, 88 baserEkson 2: 44 961 963–44 962 075, 113 baserEkson 3: 44 973 087–44 973 210, 124 baserEkson 4: 44 974 439–44 974 597, 159 baserEkson 5: 44 977 343–44 977 460, 118 baserEkson 6: 44 985 218–44 985 303, 86 baserEkson 7: 44 986 455–44 986 575, 121 baserEkson 8: 44 987 179–44 987 423, 245 baserEkson 9: 44 988 080–44 988 173, 94 baserEkson 10: 44 990 395–44 990 585, 191 baserEkson 11: 44 990 850–44 990 945, 96 baserEkson 12: 44 991 238–44 991 373, 136 baserEkson 13: 44 992 233–44 992 400, 168 baserEkson 14: 44 992 611–44 993 341, 731 baser1510145′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 2,5 kb av genets 38 kb, og 2 010 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av CLPTM1

5Lav

Hvor vanskelig CLPTM1 er å sekvensere med korte leser, av 100

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Repetisjoner5,1 %
  • GC-innhold38 %
  • Referansedekning0 %

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). CLPTM1-genet: CLPTM1 regulator of GABA type A receptor forward trafficking. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/clptm1

Vancouver

Dante Labs. CLPTM1-genet: CLPTM1 regulator of GABA type A receptor forward trafficking [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/clptm1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test