Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

CISTR

chondrogenesis-associated transcript

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
12q13.13
Koordinater
Kromosom 12: 53 746 337–53 751 979 (GRCh38)
Eksoner
3 eksoner over 5,6 kb
Også kjent som
CISTR-ACT, CISTRACT, re52431
MANE Select-transkripsjon
ENST00000663667.3NR_186108.1
Lokustype
Langt ikke-kodende RNA (lncRNA)

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser CISTR ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er CISTR bygget opp

  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
Kromosom 12, med en parentes der CISTR står. CISTR og 29 gener i nærheten på kromosom 12, fra 53 249 158 til 54 249 157.Kromosom 1212q13.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3353,4 Mb53,6 Mb53,8 Mb54 Mb54,2 MbSLC61A1: 53 251 251–53 254 406, fremover-strengSLC61A1ESPL1: 53 268 248–53 293 643, fremover-strengESPL1PFDN5: 53 295 291–53 299 455, fremover-strengPFDN5MYG1: 53 299 695–53 307 181, fremover-strengMYG1AAAS: 53 307 456–53 324 864, bakover-strengAAASSP7: 53 326 575–53 345 315, bakover-strengSP7SP1: 53 380 135–53 416 446, fremover-strengSP1AMHR2: 53 423 672–53 431 672, fremover-strengAMHR2PRR13: 53 441 308–53 446 660, fremover-strengPRR13PCBP2: 53 451 900–53 484 618, fremover-strengPCBP2MAP3K12: 53 479 669–53 500 063, bakover-strengTARBP2: 53 500 921–53 506 431, fremover-strengTARBP2NPFF: 53 506 684–53 507 491, bakover-strengNPFFATF7-NPFF: 53 506 691–53 625 979, bakover-strengATF7-NPFFATF7: 53 507 856–53 626 412, bakover-strengATF7ATP5MC2: 53 626 515–53 678 658, bakover-strengATP5MC2CALCOCO1: 53 708 517–53 727 745, bakover-strengCALCOCO1CISTR: 53 746 337–53 751 979, bakover-strengCISTRHOXC13: 53 938 718–53 946 544, fremover-strengHOXC13HOXC12: 53 954 903–53 958 956, fremover-strengHOXC12HOXC11: 53 973 126–53 977 643, fremover-strengHOXC11HOXC10: 53 985 065–53 990 279, fremover-strengHOXC10: 53 985 845–54 034 888, fremover-strengHOXC6: 53 990 624–54 030 823, fremover-strengHOXC9: 53 994 895–54 003 337, fremover-strengHOXC8: 54 008 911–54 012 769, fremover-strengHOXC4: 54 015 897–54 056 030, fremover-strengHOXC5: 54 033 048–54 035 361, fremover-strengSMUG1: 54 121 277–54 189 008, bakover-strengSMUG1CBX5: 54 230 942–54 280 141, bakover-strengCBX5Diagram av CISTR: 3 eksoner på bakover-strengen til kromosom 12Ekson 3: 53 746 337–53 746 848, 512 baserEkson 2: 53 750 317–53 750 965, 649 baserEkson 1: 53 751 774–53 751 979, 206 baser3215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 1,4 kb av genets 5,6 kb.

Sekvensering av CISTR

3Lav

Hvor vanskelig CISTR er å sekvensere med korte leser, av 100

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Repetisjoner7,5 %
  • GC-innhold19 %
  • Referansedekning0 %

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). CISTR-genet: chondrogenesis-associated transcript. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/cistr

Vancouver

Dante Labs. CISTR-genet: chondrogenesis-associated transcript [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/cistr

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test