Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

CISTR

chondrogenesis-associated transcript

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
12q13.13
Koordinaatit
Kromosomi 12: 53 746 337–53 751 979 (GRCh38)
Eksonit
3 eksonia 5,6 kb:n alueella
Tunnetaan myös nimellä
CISTR-ACT, CISTRACT, re52431
MANE Select -transkripti
ENST00000663667.3NR_186108.1
Lokustyyppi
Pitkä ei-koodaava RNA (lncRNA)

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä CISTR. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

CISTR-geenin rakenne

  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 12, jossa hakasulke osoittaa CISTR-geenin sijainnin. CISTR ja 29 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 12, välillä 53 249 158–54 249 157.Kromosomi 1212q13.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3353,4 Mb53,6 Mb53,8 Mb54 Mb54,2 MbSLC61A1: 53 251 251–53 254 406, juoste eteenpäinSLC61A1ESPL1: 53 268 248–53 293 643, juoste eteenpäinESPL1PFDN5: 53 295 291–53 299 455, juoste eteenpäinPFDN5MYG1: 53 299 695–53 307 181, juoste eteenpäinMYG1AAAS: 53 307 456–53 324 864, juoste taaksepäinAAASSP7: 53 326 575–53 345 315, juoste taaksepäinSP7SP1: 53 380 135–53 416 446, juoste eteenpäinSP1AMHR2: 53 423 672–53 431 672, juoste eteenpäinAMHR2PRR13: 53 441 308–53 446 660, juoste eteenpäinPRR13PCBP2: 53 451 900–53 484 618, juoste eteenpäinPCBP2MAP3K12: 53 479 669–53 500 063, juoste taaksepäinTARBP2: 53 500 921–53 506 431, juoste eteenpäinTARBP2NPFF: 53 506 684–53 507 491, juoste taaksepäinNPFFATF7-NPFF: 53 506 691–53 625 979, juoste taaksepäinATF7-NPFFATF7: 53 507 856–53 626 412, juoste taaksepäinATF7ATP5MC2: 53 626 515–53 678 658, juoste taaksepäinATP5MC2CALCOCO1: 53 708 517–53 727 745, juoste taaksepäinCALCOCO1CISTR: 53 746 337–53 751 979, juoste taaksepäinCISTRHOXC13: 53 938 718–53 946 544, juoste eteenpäinHOXC13HOXC12: 53 954 903–53 958 956, juoste eteenpäinHOXC12HOXC11: 53 973 126–53 977 643, juoste eteenpäinHOXC11HOXC10: 53 985 065–53 990 279, juoste eteenpäinHOXC10: 53 985 845–54 034 888, juoste eteenpäinHOXC6: 53 990 624–54 030 823, juoste eteenpäinHOXC9: 53 994 895–54 003 337, juoste eteenpäinHOXC8: 54 008 911–54 012 769, juoste eteenpäinHOXC4: 54 015 897–54 056 030, juoste eteenpäinHOXC5: 54 033 048–54 035 361, juoste eteenpäinSMUG1: 54 121 277–54 189 008, juoste taaksepäinSMUG1CBX5: 54 230 942–54 280 141, juoste taaksepäinCBX5CISTR-kaavio: 3 eksonia kromosomin 12 juosteella, taaksepäinEkson 3: 53 746 337–53 746 848, 512 emästäEkson 2: 53 750 317–53 750 965, 649 emästäEkson 1: 53 751 774–53 751 979, 206 emästä3215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,4 kb geenin 5,6 kb:stä.

CISTR-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea CISTR-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki CISTR-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa CISTR-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot7,5 %
  • GC-pitoisuus19 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). CISTR-geeni: chondrogenesis-associated transcript. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cistr

Vancouver

Dante Labs. CISTR-geeni: chondrogenesis-associated transcript [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cistr

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test