Gene
FALEC
focally amplified lncRNA regulator of ECM1
- HGNC 43713↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000228126↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 100874054↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 1q21.2
- Coordinate
- Cromosoma 1: 150.515.752–150.536.788 (GRCh38)
- Esoni
- 6 esoni su 21 kb
- Noto anche come
- ncRNA-a1, FAL1
- Simboli precedenti
- LINC00568
- Trascritto MANE Select
- ENST00000416894.2NR_186305.1
- Tipo di locus
- RNA lungo non codificante (lncRNA)
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Nessun report del Genome Test legge ancora FALEC. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di FALEC
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,1 kb dei 21 kb del gene.
Sequenziamento di FALEC
1Bassa
Quanto è difficile sequenziare FALEC con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di FALEC che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.0,9%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.11%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene FALEC: focally amplified lncRNA regulator of ECM1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/falec
Dante Labs. Gene FALEC: focally amplified lncRNA regulator of ECM1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/falec
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