Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SNRNP70

small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19q13.33
Koordináták
19. kromoszóma: 49 085 451–49 108 604 (GRCh38)
Exonok
10 exon, összesen 23,2 kb
Fehérje
437 aminosav
Más néven ismert
U1-70K, Snp1
Korábbi jelölések
RNPU1Z, RPU1, SNRP70
MANE Select transzkriptum
ENST00000598441.6NM_003089.6
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SNRNP70 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SNRNP70 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a SNRNP70 helyét zárójel jelöli. A SNRNP70 és környékén 61 gén a 19. kromoszómán, 48 597 028–49 597 027 között.19. kromoszóma19q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4348,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 Mb49,4 MbSULT2B1: 48 552 140–48 599 425, előre szálSACK1E: 48 599 961–48 615 093, fordított szálSPACA4: 48 606 742–48 607 962, előre szálRPL18: 48 615 284–48 619 213, fordított szálRPL18SPHK2: 48 619 291–48 630 717, előre szálSPHK2DBP: 48 630 030–48 637 695, fordított szálDBPCA11: 48 637 946–48 646 386, fordított szálCA11NTN5: 48 661 407–48 673 081, fordított szálNTN5FUT2: 48 695 953–48 705 951, előre szálFUT2MAMSTR: 48 711 737–48 719 966, fordított szálRASIP1: 48 720 571–48 740 616, fordított szálRASIP1IZUMO1: 48 740 852–48 746 909, fordított szálIZUMO1FUT1: 48 748 011–48 755 390, fordított szálFUT1FGF21: 48 755 524–48 758 333, előre szálFGF21BCAT2: 48 795 061–48 811 066, fordított szálBCAT2HSD17B14: 48 813 014–48 837 064, fordított szálHSD17B14PLEKHA4: 48 837 091–48 868 855, fordított szálPLEKHA4PPP1R15A: 48 872 212–48 879 061, előre szálPPP1R15ATULP2: 48 880 965–48 898 744, fordított szálTULP2NUCB1: 48 900 050–48 923 958, előre szálNUCB1DHDH: 48 933 517–48 944 969, előre szálDHDHBAX: 48 954 815–48 961 806, előre szálBAXFTL: 48 965 275–48 967 896, előre szálFTLGYS1: 48 968 125–48 993 349, fordított szálGYS1RUVBL2: 48 993 476–49 017 868, előre szálRUVBL2LHB: 49 015 980–49 017 091, fordított szálLHBSAXO3: 49 017 968–49 020 549, fordított szálCGB3: 49 022 869–49 024 360, fordított szál: 49 022 953–49 036 895, fordított szálCGB2: 49 031 890–49 033 238, előre szálCGB1: 49 035 569–49 036 895, fordított szálCGB5: 49 043 595–49 045 312, előre szálCGB8: 49 047 638–49 049 125, fordított szálCGB7: 49 054 274–49 058 860, fordított szál: 49 055 793–49 065 076, fordított szálNTF4: 49 061 066–49 065 076, fordított szálNTF4KCNA7: 49 067 397–49 072 702, fordított szálKCNA7SNRNP70: 49 085 451–49 108 604, előre szálSNRNP70LIN7B: 49 114 324–49 118 463, előre szálLIN7BC19orf73: 49 118 402–49 119 143, fordított szálC19orf73PPFIA3: 49 119 401–49 151 027, előre szálPPFIA3HRC: 49 151 014–49 155 441, fordított szálHRCTRPM4: 49 157 737–49 211 841, előre szálTRPM4SLC6A16: 49 289 638–49 325 215, fordított szálSLC6A16CD37: 49 335 171–49 343 335, előre szálCD37TEAD2: 49 340 389–49 362 729, fordított szálTEAD2DKKL1: 49 361 783–49 375 120, előre szálDKKL1KASH5: 49 388 219–49 417 990, előre szálKASH5PTH2: 49 422 419–49 423 660, fordított szálPTH2GFY: 49 423 749–49 428 987, előre szálGFYSLC17A7: 49 429 399–49 443 197, fordított szálSLC17A7PIH1D1: 49 446 291–49 453 537, fordított szálALDH16A1: 49 453 146–49 471 052, előre szál: 49 462 752–49 486 231, előre szálFLT3LG: 49 474 150–49 486 233, előre szálRPL13A: 49 487 510–49 493 057, előre szálRPS11: 49 496 233–49 499 903, előre szálRPS11FCGRT: 49 506 806–49 526 917, előre szálFCGRTRCN3: 49 526 534–49 579 703, előre szálRCN3NOSIP: 49 555 207–49 592 927, fordított szálNOSIPPRRG2: 49 580 646–49 591 004, előre szálPRRG2PRR12: 49 591 108–49 626 439, előre szálPRR12A SNRNP70 ábrája: 10 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 49 085 451–49 085 636, 186 bázis2. exon: 49 086 405–49 086 561, 157 bázis3. exon: 49 090 291–49 090 353, 63 bázis4. exon: 49 090 466–49 090 520, 55 bázis5. exon: 49 098 427–49 098 491, 65 bázis6. exon: 49 098 642–49 098 704, 63 bázis7. exon: 49 101 390–49 101 471, 82 bázis8. exon: 49 104 634–49 104 735, 102 bázis9. exon: 49 107 625–49 107 712, 88 bázis10. exon: 49 107 795–49 108 604, 810 bázis12468105′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 23,2 kb-jából 1,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1314 bázis kódolja a fehérjét.

SNRNP70 szekvenálása

14Könnyű

Mennyire nehéz a SNRNP70 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SNRNP70 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a SNRNP70 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések15%
  • GC-tartalom50%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SNRNP70 gén: small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/snrnp70

Vancouver

Dante Labs. SNRNP70 gén: small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/snrnp70

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet