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Gène

TFPT

TCF3 fusion partner

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.42
Coordonnées
Chromosome 19 : 54 107 020–54 115 657 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 8,6 kb
Protéine
253 acides aminés
Aussi appelé
FB1, amida, INO80F
Transcrit MANE Select
ENST00000391759.6NM_013342.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TFPT. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TFPT

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de TFPT. TFPT et 32 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 53 611 339 à 54 611 338.Chromosome 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4353,8 Mb54 Mb54,2 Mb54,4 Mb54,6 MbDPRX : 53 600 777–53 637 014, brin directDPRXNLRP12 : 53 792 139–53 824 403, brin inverseNLRP12MYADM : 53 864 763–53 878 125, brin directMYADMPRKCG : 53 879 190–53 907 652, brin directPRKCGCACNG7 : 53 909 264–53 943 950, brin directCACNG7CACNG8 : 53 962 937–53 990 215, brin directCACNG8CACNG6 : 53 991 605–54 012 670, brin directCACNG6VSTM1 : 54 040 825–54 063 959, brin inverseVSTM1TARM1 : 54 069 895–54 081 365, brin inverseOSCAR : 54 094 668–54 102 692, brin inverseOSCARNDUFA3 : 54 102 728–54 111 522, brin directNDUFA3TFPT : 54 107 020–54 115 657, brin inverseTFPTPRPF31 : 54 115 410–54 131 719, brin directPRPF31CNOT3 : 54 137 710–54 155 708, brin directLENG1 : 54 155 161–54 159 760, brin inverseLENG1TMC4 : 54 160 095–54 173 250, brin inverseTMC4MBOAT7 : 54 173 412–54 189 882, brin inverseTSEN34 : 54 188 464–54 194 538, brin directTSEN34RPS9 : 54 200 466–54 249 003, brin directRPS9LILRB3 : 54 215 940–54 223 506, brin inverseLILRB3LILRA6 : 54 236 590–54 242 820, brin inverseLILRA6LILRB5 : 54 249 421–54 257 339, brin inverseLILRB5LILRB2 : 54 273 812–54 281 184, brin inverseLILRA5 : 54 307 037–54 313 177, brin inverseLILRA5LILRA4 : 54 333 185–54 339 162, brin inverseLILRA4LAIR1 : 54 351 384–54 370 558, brin inverseLAIR1TTYH1 : 54 415 219–54 436 904, brin directTTYH1LENG8 : 54 449 157–54 462 022, brin directLENG8LENG9 : 54 461 732–54 463 778, brin inverseLENG9CDC42EP5 : 54 465 026–54 473 316, brin inverseCDC42EP5LAIR2 : 54 497 879–54 510 694, brin directLAIR2LILRA2 : 54 572 920–54 590 287, brin directLILRA2LILRA1 : 54 593 582–54 603 259, brin directLILRA1Schéma de TFPT : 6 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 6 : 54 107 020–54 107 169, 150 basesExon 5 : 54 108 026–54 108 244, 219 basesExon 4 : 54 108 326–54 108 395, 70 basesExon 3 : 54 110 051–54 110 121, 71 basesExon 2 : 54 114 442–54 114 700, 259 basesExon 1 : 54 115 247–54 115 657, 411 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,2 kb sur les 8,6 kb du gène ; 762 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TFPT

1

position de TFPT où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 8,6 kb de TFPT, introns compris, et pas seulement les 1,2 kb d'exons.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TFPT : TCF3 fusion partner. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tfpt

Vancouver

Dante Labs. Gène TFPT : TCF3 fusion partner [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tfpt

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