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Gène

SPATS1

spermatogenesis associated serine rich 1

Résumé

Localisation cytogénétique
6p21.1
Coordonnées
Chromosome 6 : 44 342 650–44 380 179 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 37,5 kb
Protéine
300 acides aminés
Aussi appelé
SPATA8, FLJ25442, SRSP1
Transcrit MANE Select
ENST00000674044.1NM_001372081.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SPATS1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SPATS1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de SPATS1. SPATS1 et 15 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 43 861 415 à 44 861 414.Chromosome 66p21.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2744 Mb44,2 Mb44,4 Mb44,6 Mb44,8 MbLINC03040 : 44 000 580–44 007 830, brin directLINC03040MRPL14 : 44 078 275–44 134 339, brin inverseMRPL14TMEM63B : 44 126 614–44 155 520, brin directTMEM63BCAPN11 : 44 158 811–44 184 401, brin directCAPN11MYMX : 44 192 822–44 218 236, brin directMYMXSLC29A1 : 44 219 245–44 243 425, brin directSLC29A1HSP90AB1 : 44 237 395–44 253 888, brin directSLC35B2 : 44 253 872–44 257 890, brin inverseNFKBIE : 44 258 166–44 265 788, brin inverseTMEM151B : 44 270 450–44 307 506, brin directTMEM151B : 44 273 194–44 378 957, brin directDRC5 : 44 278 718–44 297 725, brin inverseDRC5AARS2 : 44 298 726–44 313 376, brin inverseAARS2SPATS1 : 44 342 650–44 380 179, brin directSPATS1CDC5L : 44 387 547–44 450 924, brin directCDC5LSUPT3H : 44 809 317–45 377 953, brin inverseSUPT3HSchéma de SPATS1 : 9 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 1 : 44 342 650–44 342 768, 119 basesExon 2 : 44 343 096–44 343 234, 139 basesExon 3 : 44 352 726–44 352 873, 148 basesExon 4 : 44 360 446–44 360 570, 125 basesExon 5 : 44 361 831–44 361 992, 162 basesExon 6 : 44 368 379–44 368 499, 121 basesExon 7 : 44 370 051–44 370 113, 63 basesExon 8 : 44 376 358–44 376 473, 116 basesExon 9 : 44 377 035–44 380 179, 3 145 bases1595′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,1 kb sur les 37,5 kb du gène ; 903 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SPATS1 : spermatogenesis associated serine rich 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/spats1

Vancouver

Dante Labs. Gène SPATS1 : spermatogenesis associated serine rich 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/spats1

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