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Gène

SCAMP4

secretory carrier membrane protein 4

Résumé

Localisation cytogénétique
19p13.3
Coordonnées
Chromosome 19 : 1 905 399–1 926 013 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 20,6 kb
Protéine
229 acides aminés
Aussi appelé
FLJ33847
Transcrit MANE Select
ENST00000316097.13NM_079834.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SCAMP4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SCAMP4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de SCAMP4. SCAMP4 et 37 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 1 415 706 à 2 415 705.Chromosome 1919p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.431,6 Mb1,8 Mb2 Mb2,2 Mb2,4 MbDAZAP1 : 1 407 533–1 435 687, brin directDAZAP1RPS15 : 1 438 149–1 440 508, brin directRPS15APC2 : 1 446 302–1 473 244, brin directC19orf25 : 1 461 143–1 479 565, brin inversePCSK4 : 1 481 428–1 490 752, brin inversePCSK4REEP6 : 1 491 016–1 497 928, brin directREEP6ADAMTSL5 : 1 503 045–1 513 604, brin inverseADAMTSL5PLK5 : 1 507 978–1 536 046, brin directPLK5MEX3D : 1 554 672–1 568 352, brin inverseMEX3DMBD3 : 1 573 596–1 592 911, brin inverseMBD3 : 1 578 339–1 605 445, brin inverseUQCR11 : 1 593 987–1 605 500, brin inverseUQCR11TCF3 : 1 609 291–1 652 911, brin inverseTCF3ONECUT3 : 1 753 506–1 780 988, brin directONECUT3ATP8B3 : 1 781 761–1 812 295, brin inverseATP8B3REXO1 : 1 815 248–1 848 493, brin inverseREXO1KLF16 : 1 852 399–1 863 919, brin inverseKLF16ABHD17A : 1 876 810–1 885 618, brin inverseABHD17AADAT3 : 1 905 214–1 913 448, brin directADAT3SCAMP4 : 1 905 399–1 926 013, brin directSCAMP4CSNK1G2 : 1 940 915–1 981 339, brin directCSNK1G2BTBD2 : 1 985 438–2 034 881, brin inverseBTBD2MKNK2 : 2 037 465–2 061 220, brin inverseMKNK2MOB3A : 2 071 014–2 096 679, brin inverseMOB3AIZUMO4 : 2 096 415–2 099 593, brin directIZUMO4AP3D1 : 2 100 982–2 164 468, brin inverseAP3D1DOT1L : 2 163 933–2 232 578, brin directDOT1LPLEKHJ1 : 2 229 981–2 237 704, brin inversePLEKHJ1SF3A2 : 2 236 813–2 248 677, brin directSF3A2AMH : 2 249 309–2 252 073, brin directAMHJSRP1 : 2 252 074–2 269 759, brin inverseOAZ1 : 2 269 509–2 273 492, brin direct : 2 269 525–2 341 172, brin directPEAK3 : 2 274 626–2 282 209, brin inverseLINGO3 : 2 287 164–2 308 177, brin inverseLSM7 : 2 321 507–2 328 630, brin inverseLSM7SPPL2B : 2 328 346–2 355 100, brin directSPPL2BTMPRSS9 : 2 360 238–2 426 261, brin directTMPRSS9Schéma de SCAMP4 : 7 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 1 905 399–1 905 439, 41 basesExon 2 : 1 914 979–1 915 026, 48 basesExon 3 : 1 917 694–1 917 822, 129 basesExon 4 : 1 918 127–1 918 283, 157 basesExon 5 : 1 918 889–1 918 990, 102 basesExon 6 : 1 923 070–1 923 187, 118 basesExon 7 : 1 924 108–1 926 013, 1 906 bases12345675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,5 kb sur les 20,6 kb du gène ; 690 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SCAMP4

1

position dans SCAMP4 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 20,6 kb de SCAMP4, introns compris, et pas seulement les 2,5 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SCAMP4 : secretory carrier membrane protein 4. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/scamp4

Vancouver

Dante Labs. Gène SCAMP4 : secretory carrier membrane protein 4 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/scamp4

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