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Gène

RNF139

ring finger protein 139

Résumé

Localisation cytogénétique
8q24.13
Coordonnées
Chromosome 8 : 124 474 880–124 488 618 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 13,7 kb
Protéine
664 acides aminés
Aussi appelé
TRC8, RCA1, HRCA1
Transcrit MANE Select
ENST00000303545.4NM_007218.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RNF139. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RNF139

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de RNF139. RNF139 et 7 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 123 981 749 à 124 981 748.Chromosome 88q24.13p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3124 Mb124,2 Mb124,4 Mb124,6 Mb124,8 MbFER1L6 : 123 851 987–124 122 188, brin directFER1L6TMEM65 : 124 305 120–124 372 711, brin inverseTMEM65TYW2 : 124 450 820–124 462 150, brin directTYW2RNF139 : 124 474 880–124 488 618, brin directRNF139TATDN1 : 124 488 485–124 539 458, brin inverseTATDN1NDUFB9 : 124 539 098–124 580 648, brin directNDUFB9MTSS1 : 124 550 772–124 728 948, brin inverseMTSS1ZNF572 : 124 973 265–124 992 210, brin directZNF572Schéma de RNF139 : 2 exons sur le brin direct du chromosome 8Exon 1 : 124 474 880–124 475 290, 411 basesExon 2 : 124 485 831–124 488 618, 2 788 bases125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,2 kb sur les 13,7 kb du gène ; 1 995 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RNF139

2Facile

Difficulté de séquençage de RNF139 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de RNF139 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de RNF139 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0,8 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions5,7 %
  • Teneur en GC12 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Traits associés à RNF139

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que RNF139 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RNF139 : ring finger protein 139. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rnf139

Vancouver

Dante Labs. Gène RNF139 : ring finger protein 139 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rnf139

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