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Gène

RIF1

replication timing regulatory factor 1

Résumé

Localisation cytogénétique
2q23.3
Coordonnées
Chromosome 2 : 151 409 902–151 482 172 (GRCh38)
Exons
36 exons sur 72,3 kb
Protéine
2 472 acides aminés
Aussi appelé
FLJ12870, FLJ10599
Transcrit MANE Select
ENST00000444746.7NM_018151.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RIF1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RIF1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de RIF1. RIF1 et 7 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 150 946 037 à 151 946 036.Chromosome 22q23.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3151 Mb151,2 Mb151,4 Mb151,6 Mb151,8 MbRBM43 : 151 247 940–151 261 870, brin inverseRBM43NMI : 151 270 467–151 289 921, brin inverseNMITNFAIP6 : 151 357 585–151 380 931, brin directTNFAIP6RIF1 : 151 409 902–151 482 172, brin directRIF1NEB : 151 485 336–151 734 515, brin inverseNEBARL5A : 151 766 233–151 828 531, brin inverseARL5A : 151 802 651–151 973 949, brin inverseCACNB4 : 151 832 771–152 099 182, brin inverseCACNB4Schéma de RIF1 : 36 exons sur le brin direct du chromosome 2Exon 1 : 151 409 902–151 410 033, 132 basesExon 2 : 151 410 414–151 410 527, 114 basesExon 3 : 151 411 260–151 411 338, 79 basesExon 4 : 151 414 823–151 414 919, 97 basesExon 5 : 151 416 561–151 416 688, 128 basesExon 6 : 151 416 807–151 416 901, 95 basesExon 7 : 151 420 190–151 420 379, 190 basesExon 8 : 151 422 950–151 423 042, 93 basesExon 9 : 151 428 784–151 428 922, 139 basesExon 10 : 151 433 077–151 433 228, 152 basesExon 11 : 151 435 463–151 435 580, 118 basesExon 12 : 151 436 827–151 437 003, 177 basesExon 13 : 151 437 241–151 437 351, 111 basesExon 14 : 151 438 684–151 438 746, 63 basesExon 15 : 151 440 027–151 440 127, 101 basesExon 16 : 151 441 905–151 441 991, 87 basesExon 17 : 151 443 259–151 443 329, 71 basesExon 18 : 151 443 529–151 443 709, 181 basesExon 19 : 151 445 338–151 445 445, 108 basesExon 20 : 151 446 426–151 446 575, 150 basesExon 21 : 151 451 606–151 451 705, 100 basesExon 22 : 151 454 895–151 455 159, 265 basesExon 23 : 151 456 578–151 456 620, 43 basesExon 24 : 151 457 761–151 457 963, 203 basesExon 25 : 151 458 811–151 458 910, 100 basesExon 26 : 151 460 000–151 460 119, 120 basesExon 27 : 151 461 138–151 461 289, 152 basesExon 28 : 151 462 242–151 462 322, 81 basesExon 29 : 151 462 412–151 462 466, 55 basesExon 30 : 151 462 884–151 466 120, 3 237 basesExon 31 : 151 468 000–151 468 146, 147 basesExon 32 : 151 468 474–151 468 551, 78 basesExon 33 : 151 468 641–151 468 756, 116 basesExon 34 : 151 469 711–151 469 864, 154 basesExon 35 : 151 473 964–151 474 072, 109 basesExon 36 : 151 474 857–151 482 172, 7 316 bases15101520253035365′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 14,7 kb sur les 72,3 kb du gène ; 7 419 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit RIF1

1

position dans RIF1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 72,3 kb de RIF1, introns compris, et pas seulement les 14,7 kb d'exons.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène RIF1 : replication timing regulatory factor 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rif1

Vancouver

Dante Labs. Gène RIF1 : replication timing regulatory factor 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rif1

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