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Gène

PCDHGC3

protocadherin gamma subfamily C, 3

Résumé

Localisation cytogénétique
5q31.3
Coordonnées
Chromosome 5 : 141 475 966–141 512 975 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 37 kb
Protéine
934 acides aminés
Aussi appelé
PC-43, PC43, PCDH-GAMMA-C3
Symboles précédents
PCDH2
Transcrit MANE Select
ENST00000308177.5NM_002588.4
Type de locus
complex locus constituent
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de PCDHGC3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de PCDHGC3. PCDHGC3 et 65 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 140 994 471 à 141 994 470.Chromosome 55q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1 : 140 786 136–141 012 351, brin directPCDHA2 : 140 794 845–141 012 351, brin directPCDHA3 : 140 801 018–141 012 351, brin directPCDHA4 : 140 807 037–141 012 347, brin directPCDHA5 : 140 821 599–141 012 347, brin directPCDHA6 : 140 827 958–141 012 351, brin directPCDHA7 : 140 834 231–141 012 351, brin directPCDHA8 : 140 841 185–141 012 351, brin directPCDHA9 : 140 847 772–141 012 351, brin directPCDHA10 : 140 855 883–141 012 351, brin directPCDHA11 : 140 868 183–141 012 351, brin directPCDHA12 : 140 875 256–141 012 351, brin directPCDHA13 : 140 882 079–141 012 347, brin directPCDHA13PCDHAC1 : 140 926 299–141 012 351, brin directPCDHAC1PCDHAC2 : 140 966 466–141 012 351, brin directPCDHAC2PCDHB1 : 141 051 374–141 059 346, brin directPCDHB1PCDHB2 : 141 094 597–141 098 703, brin directPCDHB3 : 141 100 473–141 103 827, brin directPCDHB3PCDHB4 : 141 121 818–141 125 623, brin directPCDHB4PCDHB5 : 141 135 206–141 138 615, brin directPCDHB5PCDHB6 : 141 150 057–141 153 287, brin directPCDHB6PCDHB7 : 141 172 644–141 176 383, brin directPCDHB8 : 141 177 790–141 182 369, brin directPCDHB8PCDHB16 : 141 182 387–141 186 226, brin directPCDHB9 : 141 187 127–141 191 541, brin directPCDHB10 : 141 192 353–141 195 647, brin directPCDHB11 : 141 199 610–141 203 779, brin directPCDHB12 : 141 208 697–141 212 571, brin directPCDHB13 : 141 213 919–141 218 979, brin directPCDHB13PCDHB14 : 141 223 343–141 227 759, brin directPCDHB14 : 141 223 372–141 245 861, brin directPCDHB15 : 141 245 395–141 249 365, brin directPCDHB15TAF7 : 141 259 884–141 320 784, brin inverseTAF7SLC25A2 : 141 302 635–141 304 049, brin inverseSLC25A2PCDHGA1 : 141 330 495–141 512 977, brin directPCDHGA2 : 141 338 754–141 512 977, brin directPCDHGA3 : 141 343 819–141 512 977, brin directPCDHGB1 : 141 350 083–141 512 977, brin directPCDHGA4 : 141 355 004–141 512 977, brin directPCDHGB2 : 141 359 971–141 512 977, brin directPCDHGA5 : 141 364 162–141 512 977, brin directPCDHGB3 : 141 370 237–141 512 977, brin directPCDHGA6 : 141 373 878–141 512 977, brin directPCDHGA7 : 141 382 702–141 512 977, brin directPCDHGB4 : 141 387 698–141 512 977, brin directPCDHGA8 : 141 390 157–141 512 977, brin directPCDHGB5 : 141 397 942–141 512 977, brin directPCDHGA9 : 141 402 765–141 512 977, brin directPCDHGB6 : 141 407 989–141 512 977, brin directPCDHGA10 : 141 412 981–141 512 977, brin directPCDHGB7 : 141 417 642–141 512 977, brin directPCDHGA11 : 141 421 021–141 512 977, brin directPCDHGA12 : 141 430 507–141 512 977, brin directPCDHGA12PCDHGC3 : 141 475 966–141 512 975, brin directPCDHGC3PCDHGC4 : 141 484 997–141 512 977, brin directPCDHGC4PCDHGC5 : 141 489 067–141 512 977, brin directPCDHGC5DIAPH1 : 141 515 016–141 619 194, brin inverseHDAC3 : 141 620 766–141 637 304, brin inverseHDAC3RELL2 : 141 636 950–141 641 065, brin directRELL2FCHSD1 : 141 639 296–141 651 430, brin inverseFCHSD1ARAP3 : 141 653 204–141 682 255, brin inverseARAP3PCDH1 : 141 853 090–141 879 246, brin inversePCDH1DELE1 : 141 923 800–141 952 031, brin directDELE1PCDH12 : 141 943 581–141 969 741, brin inversePCDH12RNF14 : 141 958 305–142 003 016, brin directRNF14GNPDA1 : 141 991 749–142 013 061, brin inverseGNPDA1Schéma de PCDHGC3 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 1 : 141 475 966–141 478 546, 2 581 basesExon 2 : 141 494 807–141 494 865, 59 basesExon 3 : 141 505 393–141 505 481, 89 basesExon 4 : 141 510 947–141 512 975, 2 029 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,8 kb sur les 37 kb du gène ; 2 805 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PCDHGC3 : protocadherin gamma subfamily C, 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pcdhgc3

Vancouver

Dante Labs. Gène PCDHGC3 : protocadherin gamma subfamily C, 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pcdhgc3

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