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Gène

PCDHAC1

protocadherin alpha subfamily C, 1

Résumé

Localisation cytogénétique
5q31.3
Coordonnées
Chromosome 5 : 140 926 299–141 012 347 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 86 kb
Protéine
963 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000253807.3NM_018898.5
Type de locus
complex locus constituent
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de PCDHAC1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de PCDHAC1. PCDHAC1 et 68 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 140 469 323 à 141 469 322.Chromosome 55q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3140,6 Mb140,8 Mb141 Mb141,2 Mb141,4 MbANKHD1 : 140 401 660–140 541 168, brin directANKHD1-EIF4EBP3 : 140 401 908–140 549 569, brin directSRA1 : 140 536 450–140 557 920, brin inverseEIF4EBP3 : 140 547 616–140 551 708, brin directEIF4EBP3APBB3 : 140 558 268–140 564 781, brin inverseAPBB3SLC35A4 : 140 564 440–140 569 215, brin directSLC35A4SURMIR : 140 564 440–140 569 215, brin directSURMIRCD14 : 140 630 402–140 633 711, brin inverseNDUFA2 : 140 638 740–140 647 823, brin inverseTMCO6 : 140 639 396–140 647 730, brin directIK : 140 647 058–140 662 480, brin directIKWDR55 : 140 664 476–140 674 124, brin directDND1 : 140 670 794–140 673 576, brin inverseDND1HARS1 : 140 673 035–140 691 537, brin inverseHARS1HARS2 : 140 691 422–140 699 315, brin directHARS2ZMAT2 : 140 698 680–140 707 729, brin directZMAT2PCDHA1 : 140 786 136–141 012 351, brin directPCDHA2 : 140 794 845–141 012 351, brin directPCDHA3 : 140 801 018–141 012 351, brin directPCDHA4 : 140 807 037–141 012 347, brin directPCDHA5 : 140 821 599–141 012 347, brin directPCDHA6 : 140 827 958–141 012 351, brin directPCDHA7 : 140 834 231–141 012 351, brin directPCDHA8 : 140 841 185–141 012 351, brin directPCDHA9 : 140 847 772–141 012 351, brin directPCDHA10 : 140 855 883–141 012 351, brin directPCDHA11 : 140 868 183–141 012 351, brin directPCDHA12 : 140 875 256–141 012 351, brin directPCDHA12PCDHA13 : 140 882 079–141 012 347, brin directPCDHA13PCDHAC1 : 140 926 299–141 012 347, brin directPCDHAC1PCDHAC2 : 140 966 466–141 012 351, brin directPCDHAC2PCDHB1 : 141 051 374–141 059 346, brin directPCDHB1PCDHB2 : 141 094 597–141 098 703, brin directPCDHB2PCDHB3 : 141 100 473–141 103 827, brin directPCDHB3PCDHB4 : 141 121 818–141 125 623, brin directPCDHB4PCDHB5 : 141 135 206–141 138 615, brin directPCDHB5PCDHB6 : 141 150 057–141 153 287, brin directPCDHB7 : 141 172 644–141 176 383, brin directPCDHB7PCDHB8 : 141 177 790–141 182 369, brin directPCDHB8PCDHB16 : 141 182 387–141 186 226, brin directPCDHB9 : 141 187 127–141 191 541, brin directPCDHB10 : 141 192 353–141 195 647, brin directPCDHB11 : 141 199 610–141 203 779, brin directPCDHB12 : 141 208 697–141 212 571, brin directPCDHB12PCDHB13 : 141 213 919–141 218 979, brin directPCDHB14 : 141 223 343–141 227 759, brin direct : 141 223 372–141 245 861, brin directPCDHB15 : 141 245 395–141 249 365, brin directPCDHB15TAF7 : 141 259 884–141 320 784, brin inverseTAF7SLC25A2 : 141 302 635–141 304 049, brin inverseSLC25A2PCDHGA1 : 141 330 495–141 512 977, brin directPCDHGA1PCDHGA2 : 141 338 754–141 512 977, brin directPCDHGA2PCDHGA3 : 141 343 819–141 512 977, brin directPCDHGA3PCDHGB1 : 141 350 083–141 512 977, brin directPCDHGB1PCDHGA4 : 141 355 004–141 512 977, brin directPCDHGB2 : 141 359 971–141 512 977, brin directPCDHGA5 : 141 364 162–141 512 977, brin directPCDHGB3 : 141 370 237–141 512 977, brin directPCDHGA6 : 141 373 878–141 512 977, brin directPCDHGA7 : 141 382 702–141 512 977, brin directPCDHGB4 : 141 387 698–141 512 977, brin directPCDHGA8 : 141 390 157–141 512 977, brin directPCDHGB5 : 141 397 942–141 512 977, brin directPCDHGA9 : 141 402 765–141 512 977, brin directPCDHGB6 : 141 407 989–141 512 977, brin directPCDHGA10 : 141 412 981–141 512 977, brin directPCDHGB7 : 141 417 642–141 512 977, brin directPCDHGA11 : 141 421 021–141 512 977, brin directPCDHGA12 : 141 430 507–141 512 977, brin directSchéma de PCDHAC1 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 1 : 140 926 299–140 929 325, 3 027 basesExon 2 : 140 978 949–140 979 007, 59 basesExon 3 : 140 982 475–140 982 563, 89 basesExon 4 : 141 009 627–141 012 347, 2 721 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,9 kb sur les 86 kb du gène ; 2 892 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

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Dante Labs. (s.d.). Gène PCDHAC1 : protocadherin alpha subfamily C, 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pcdhac1

Vancouver

Dante Labs. Gène PCDHAC1 : protocadherin alpha subfamily C, 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pcdhac1

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