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Gène

PCDHGA1

protocadherin gamma subfamily A, 1

Résumé

Localisation cytogénétique
5q31
Coordonnées
Chromosome 5 : 141 330 514–141 512 975 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 182,5 kb
Protéine
931 acides aminés
Aussi appelé
PCDH-GAMMA-A1
Transcrit MANE Select
ENST00000517417.3NM_018912.3
Type de locus
complex locus constituent
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PCDHGA1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PCDHGA1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de PCDHGA1. PCDHGA1 et 61 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 140 921 745 à 141 921 744.Chromosome 55q31p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1 : 140 786 136–141 012 351, brin directPCDHA2 : 140 794 845–141 012 351, brin directPCDHA3 : 140 801 018–141 012 351, brin directPCDHA4 : 140 807 037–141 012 347, brin directPCDHA5 : 140 821 599–141 012 347, brin directPCDHA6 : 140 827 958–141 012 351, brin directPCDHA7 : 140 834 231–141 012 351, brin directPCDHA8 : 140 841 185–141 012 351, brin directPCDHA9 : 140 847 772–141 012 351, brin directPCDHA10 : 140 855 883–141 012 351, brin directPCDHA11 : 140 868 183–141 012 351, brin directPCDHA12 : 140 875 256–141 012 351, brin directPCDHA12PCDHA13 : 140 882 079–141 012 347, brin directPCDHA13PCDHAC1 : 140 926 299–141 012 351, brin directPCDHAC1PCDHAC2 : 140 966 466–141 012 351, brin directPCDHAC2PCDHB1 : 141 051 374–141 059 346, brin directPCDHB1PCDHB2 : 141 094 597–141 098 703, brin directPCDHB3 : 141 100 473–141 103 827, brin directPCDHB3PCDHB4 : 141 121 818–141 125 623, brin directPCDHB4PCDHB5 : 141 135 206–141 138 615, brin directPCDHB5PCDHB6 : 141 150 057–141 153 287, brin directPCDHB6PCDHB7 : 141 172 644–141 176 383, brin directPCDHB8 : 141 177 790–141 182 369, brin directPCDHB8PCDHB16 : 141 182 387–141 186 226, brin directPCDHB9 : 141 187 127–141 191 541, brin directPCDHB10 : 141 192 353–141 195 647, brin directPCDHB11 : 141 199 610–141 203 779, brin directPCDHB12 : 141 208 697–141 212 571, brin directPCDHB13 : 141 213 919–141 218 979, brin directPCDHB13PCDHB14 : 141 223 343–141 227 759, brin directPCDHB14 : 141 223 372–141 245 861, brin directPCDHB15 : 141 245 395–141 249 365, brin directPCDHB15TAF7 : 141 259 884–141 320 784, brin inverseTAF7SLC25A2 : 141 302 635–141 304 049, brin inverseSLC25A2PCDHGA1 : 141 330 514–141 512 975, brin directPCDHGA1PCDHGA2 : 141 338 754–141 512 977, brin directPCDHGA2PCDHGA3 : 141 343 819–141 512 977, brin directPCDHGA3PCDHGB1 : 141 350 083–141 512 977, brin directPCDHGB1PCDHGA4 : 141 355 004–141 512 977, brin directPCDHGB2 : 141 359 971–141 512 977, brin directPCDHGA5 : 141 364 162–141 512 977, brin directPCDHGB3 : 141 370 237–141 512 977, brin directPCDHGA6 : 141 373 878–141 512 977, brin directPCDHGA7 : 141 382 702–141 512 977, brin directPCDHGB4 : 141 387 698–141 512 977, brin directPCDHGA8 : 141 390 157–141 512 977, brin directPCDHGB5 : 141 397 942–141 512 977, brin directPCDHGA9 : 141 402 765–141 512 977, brin directPCDHGB6 : 141 407 989–141 512 977, brin directPCDHGA10 : 141 412 981–141 512 977, brin directPCDHGB7 : 141 417 642–141 512 977, brin directPCDHGA11 : 141 421 021–141 512 977, brin directPCDHGA12 : 141 430 507–141 512 977, brin directPCDHGC3 : 141 475 929–141 512 977, brin directPCDHGC4 : 141 484 997–141 512 977, brin directPCDHGC5 : 141 489 067–141 512 977, brin directDIAPH1 : 141 515 016–141 619 194, brin inverseHDAC3 : 141 620 766–141 637 304, brin inverseHDAC3RELL2 : 141 636 950–141 641 065, brin directRELL2FCHSD1 : 141 639 296–141 651 430, brin inverseFCHSD1ARAP3 : 141 653 204–141 682 255, brin inverseARAP3PCDH1 : 141 853 090–141 879 246, brin inversePCDH1Schéma de PCDHGA1 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 1 : 141 330 514–141 333 105, 2 592 basesExon 2 : 141 494 807–141 494 865, 59 basesExon 3 : 141 505 393–141 505 481, 89 basesExon 4 : 141 510 947–141 512 975, 2 029 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,8 kb sur les 182,5 kb du gène ; 2 796 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PCDHGA1 : protocadherin gamma subfamily A, 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pcdhga1

Vancouver

Dante Labs. Gène PCDHGA1 : protocadherin gamma subfamily A, 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pcdhga1

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