Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PCDHGC3

protocadherin gamma subfamily C, 3

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
5q31.3
Koordináták
5. kromoszóma: 141 475 966–141 512 975 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 37 kb
Fehérje
934 aminosav
Más néven ismert
PC-43, PC43, PCDH-GAMMA-C3
Korábbi jelölések
PCDH2
MANE Select transzkriptum
ENST00000308177.5NM_002588.4
Lokusz típusa
Egyéb
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PCDHGC3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PCDHGC3 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
5. kromoszóma, a PCDHGC3 helyét zárójel jelöli. A PCDHGC3 és környékén 65 gén a 5. kromoszómán, 140 994 471–141 994 470 között.5. kromoszóma5q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1: 140 786 136–141 012 351, előre szálPCDHA2: 140 794 845–141 012 351, előre szálPCDHA3: 140 801 018–141 012 351, előre szálPCDHA4: 140 807 037–141 012 347, előre szálPCDHA5: 140 821 599–141 012 347, előre szálPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, előre szálPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, előre szálPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, előre szálPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, előre szálPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, előre szálPCDHA11: 140 868 183–141 012 351, előre szálPCDHA12: 140 875 256–141 012 351, előre szálPCDHA13: 140 882 079–141 012 347, előre szálPCDHA13PCDHAC1: 140 926 299–141 012 351, előre szálPCDHAC1PCDHAC2: 140 966 466–141 012 351, előre szálPCDHAC2PCDHB1: 141 051 374–141 059 346, előre szálPCDHB1PCDHB2: 141 094 597–141 098 703, előre szálPCDHB3: 141 100 473–141 103 827, előre szálPCDHB3PCDHB4: 141 121 818–141 125 623, előre szálPCDHB4PCDHB5: 141 135 206–141 138 615, előre szálPCDHB5PCDHB6: 141 150 057–141 153 287, előre szálPCDHB6PCDHB7: 141 172 644–141 176 383, előre szálPCDHB8: 141 177 790–141 182 369, előre szálPCDHB8PCDHB16: 141 182 387–141 186 226, előre szálPCDHB9: 141 187 127–141 191 541, előre szálPCDHB10: 141 192 353–141 195 647, előre szálPCDHB11: 141 199 610–141 203 779, előre szálPCDHB12: 141 208 697–141 212 571, előre szálPCDHB13: 141 213 919–141 218 979, előre szálPCDHB13PCDHB14: 141 223 343–141 227 759, előre szálPCDHB14: 141 223 372–141 245 861, előre szálPCDHB15: 141 245 395–141 249 365, előre szálPCDHB15TAF7: 141 259 884–141 320 784, fordított szálTAF7SLC25A2: 141 302 635–141 304 049, fordított szálSLC25A2PCDHGA1: 141 330 495–141 512 977, előre szálPCDHGA2: 141 338 754–141 512 977, előre szálPCDHGA3: 141 343 819–141 512 977, előre szálPCDHGB1: 141 350 083–141 512 977, előre szálPCDHGA4: 141 355 004–141 512 977, előre szálPCDHGB2: 141 359 971–141 512 977, előre szálPCDHGA5: 141 364 162–141 512 977, előre szálPCDHGB3: 141 370 237–141 512 977, előre szálPCDHGA6: 141 373 878–141 512 977, előre szálPCDHGA7: 141 382 702–141 512 977, előre szálPCDHGB4: 141 387 698–141 512 977, előre szálPCDHGA8: 141 390 157–141 512 977, előre szálPCDHGB5: 141 397 942–141 512 977, előre szálPCDHGA9: 141 402 765–141 512 977, előre szálPCDHGB6: 141 407 989–141 512 977, előre szálPCDHGA10: 141 412 981–141 512 977, előre szálPCDHGB7: 141 417 642–141 512 977, előre szálPCDHGA11: 141 421 021–141 512 977, előre szálPCDHGA12: 141 430 507–141 512 977, előre szálPCDHGA12PCDHGC3: 141 475 966–141 512 975, előre szálPCDHGC3PCDHGC4: 141 484 997–141 512 977, előre szálPCDHGC4PCDHGC5: 141 489 067–141 512 977, előre szálPCDHGC5DIAPH1: 141 515 016–141 619 194, fordított szálHDAC3: 141 620 766–141 637 304, fordított szálHDAC3RELL2: 141 636 950–141 641 065, előre szálRELL2FCHSD1: 141 639 296–141 651 430, fordított szálFCHSD1ARAP3: 141 653 204–141 682 255, fordított szálARAP3PCDH1: 141 853 090–141 879 246, fordított szálPCDH1DELE1: 141 923 800–141 952 031, előre szálDELE1PCDH12: 141 943 581–141 969 741, fordított szálPCDH12RNF14: 141 958 305–142 003 016, előre szálRNF14GNPDA1: 141 991 749–142 013 061, fordított szálGNPDA1A PCDHGC3 ábrája: 4 exon a(z) 5. kromoszóma előre szálán1. exon: 141 475 966–141 478 546, 2581 bázis2. exon: 141 494 807–141 494 865, 59 bázis3. exon: 141 505 393–141 505 481, 89 bázis4. exon: 141 510 947–141 512 975, 2029 bázis12345′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 37 kb-jából 4,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2805 bázis kódolja a fehérjét.

PCDHGC3 szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a PCDHGC3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PCDHGC3 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PCDHGC3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,8%
  • GC-tartalom5,2%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PCDHGC3 gén: protocadherin gamma subfamily C, 3. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pcdhgc3

Vancouver

Dante Labs. PCDHGC3 gén: protocadherin gamma subfamily C, 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pcdhgc3

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet