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Gène

PCDHA1

protocadherin alpha 1

Résumé

Localisation cytogénétique
5q31.3
Coordonnées
Chromosome 5 : 140 786 140–141 012 347 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 226,2 kb
Protéine
950 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000504120.4NM_018900.4
Type de locus
complex locus constituent
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PCDHA1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PCDHA1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de PCDHA1. PCDHA1 et 62 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 140 399 244 à 141 399 243.Chromosome 55q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3140,4 Mb140,6 Mb140,8 Mb141 Mb141,2 MbANKHD1 : 140 401 660–140 541 168, brin directANKHD1-EIF4EBP3 : 140 401 908–140 549 569, brin directSRA1 : 140 536 450–140 557 920, brin inverseEIF4EBP3 : 140 547 616–140 551 708, brin directEIF4EBP3APBB3 : 140 558 268–140 564 781, brin inverseAPBB3SLC35A4 : 140 564 440–140 569 215, brin directSLC35A4SURMIR : 140 564 440–140 569 215, brin directSURMIRCD14 : 140 630 402–140 633 711, brin inverseNDUFA2 : 140 638 740–140 647 823, brin inverseTMCO6 : 140 639 396–140 647 730, brin directIK : 140 647 058–140 662 480, brin directIKWDR55 : 140 664 476–140 674 124, brin directDND1 : 140 670 794–140 673 576, brin inverseDND1HARS1 : 140 673 035–140 691 537, brin inverseHARS1HARS2 : 140 691 422–140 699 315, brin directHARS2ZMAT2 : 140 698 680–140 707 729, brin directZMAT2PCDHA1 : 140 786 140–141 012 347, brin directPCDHA1PCDHA2 : 140 794 845–141 012 351, brin directPCDHA2PCDHA3 : 140 801 018–141 012 351, brin directPCDHA3PCDHA4 : 140 807 037–141 012 347, brin directPCDHA4PCDHA5 : 140 821 599–141 012 347, brin directPCDHA6 : 140 827 958–141 012 351, brin directPCDHA7 : 140 834 231–141 012 351, brin directPCDHA8 : 140 841 185–141 012 351, brin directPCDHA9 : 140 847 772–141 012 351, brin directPCDHA10 : 140 855 883–141 012 351, brin directPCDHA11 : 140 868 183–141 012 351, brin directPCDHA12 : 140 875 256–141 012 351, brin directPCDHA13 : 140 882 079–141 012 347, brin directPCDHAC1 : 140 926 299–141 012 351, brin directPCDHAC2 : 140 966 466–141 012 351, brin directPCDHB1 : 141 051 374–141 059 346, brin directPCDHB1PCDHB2 : 141 094 597–141 098 703, brin directPCDHB2PCDHB3 : 141 100 473–141 103 827, brin directPCDHB3PCDHB4 : 141 121 818–141 125 623, brin directPCDHB4PCDHB5 : 141 135 206–141 138 615, brin directPCDHB5PCDHB6 : 141 150 057–141 153 287, brin directPCDHB7 : 141 172 644–141 176 383, brin directPCDHB7PCDHB8 : 141 177 790–141 182 369, brin directPCDHB8PCDHB16 : 141 182 387–141 186 226, brin directPCDHB9 : 141 187 127–141 191 541, brin directPCDHB10 : 141 192 353–141 195 647, brin directPCDHB11 : 141 199 610–141 203 779, brin directPCDHB12 : 141 208 697–141 212 571, brin directPCDHB12PCDHB13 : 141 213 919–141 218 979, brin directPCDHB14 : 141 223 343–141 227 759, brin direct : 141 223 372–141 245 861, brin directPCDHB15 : 141 245 395–141 249 365, brin directPCDHB15TAF7 : 141 259 884–141 320 784, brin inverseTAF7SLC25A2 : 141 302 635–141 304 049, brin inverseSLC25A2PCDHGA1 : 141 330 495–141 512 977, brin directPCDHGA1PCDHGA2 : 141 338 754–141 512 977, brin directPCDHGA2PCDHGA3 : 141 343 819–141 512 977, brin directPCDHGA3PCDHGB1 : 141 350 083–141 512 977, brin directPCDHGB1PCDHGA4 : 141 355 004–141 512 977, brin directPCDHGB2 : 141 359 971–141 512 977, brin directPCDHGA5 : 141 364 162–141 512 977, brin directPCDHGB3 : 141 370 237–141 512 977, brin directPCDHGA6 : 141 373 878–141 512 977, brin directPCDHGA7 : 141 382 702–141 512 977, brin directPCDHGB4 : 141 387 698–141 512 977, brin directPCDHGA8 : 141 390 157–141 512 977, brin directPCDHGB5 : 141 397 942–141 512 977, brin directSchéma de PCDHA1 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 1 : 140 786 140–140 788 684, 2 545 basesExon 2 : 140 978 949–140 979 007, 59 basesExon 3 : 140 982 475–140 982 563, 89 basesExon 4 : 141 009 627–141 012 347, 2 721 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,4 kb sur les 226,2 kb du gène ; 2 853 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène PCDHA1 : protocadherin alpha 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pcdha1

Vancouver

Dante Labs. Gène PCDHA1 : protocadherin alpha 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pcdha1

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