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Gène

GDPD3

glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3

Résumé

Localisation cytogénétique
16p11.2
Coordonnées
Chromosome 16 : 30 104 810–30 113 537 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 8,7 kb
Protéine
318 acides aminés
Aussi appelé
MGC4171
Transcrit MANE Select
ENST00000406256.8NM_024307.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de GDPD3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de GDPD3. GDPD3 et 49 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 29 609 174 à 30 609 173.Chromosome 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329,8 Mb30 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 MbQPRT : 29 662 957–29 698 704, brin directQPRTSPN : 29 662 957–29 670 876, brin directSPNC16orf54 : 29 742 463–29 746 079, brin inverseC16orf54ZG16 : 29 760 591–29 783 885, brin directZG16KIF22 : 29 790 137–29 805 388, brin directMAZ : 29 805 637–29 811 176, brin directPRRT2 : 29 811 382–29 815 892, brin direct : 29 812 261–29 820 092, brin directPAGR1 : 29 816 086–29 822 489, brin directPAGR1 : 29 817 239–29 830 627, brin directMVP : 29 820 394–29 848 039, brin directMVPCDIPT : 29 857 474–29 863 414, brin inverseCDIPTSEZ6L2 : 29 871 159–29 899 582, brin inverseSEZ6L2ASPHD1 : 29 900 363–29 919 864, brin directASPHD1KCTD13 : 29 903 877–29 926 236, brin inverseKCTD13TMEM219 : 29 940 885–29 973 052, brin directTMEM219TAOK2 : 29 973 675–29 992 262, brin directHIRIP3 : 29 992 314–29 996 126, brin inverseINO80E : 29 994 983–30 005 794, brin directINO80EDOC2A : 30 005 507–30 023 270, brin inverseDOC2AFIMP1 : 30 023 198–30 027 736, brin directFIMP1TLCD3B : 30 024 425–30 052 978, brin inverse : 30 053 101–30 071 526, brin directALDOA : 30 064 164–30 070 457, brin directPPP4C : 30 075 967–30 085 391, brin directTBX6 : 30 085 793–30 091 933, brin inverseTBX6YPEL3 : 30 092 314–30 096 915, brin inverseYPEL3GDPD3 : 30 104 810–30 113 537, brin inverseGDPD3MAPK3 : 30 114 104–30 123 506, brin inverseMAPK3CORO1A : 30 182 798–30 189 085, brin directCORO1ABOLA2B : 30 192 928–30 194 306, brin inverseBOLA2BSLX1A : 30 193 875–30 197 566, brin directSLX1ASULT1A3 : 30 198 059–30 204 324, brin directSULT1A3NPIPB13 : 30 222 893–30 255 268, brin inverseCD2BP2 : 30 341 365–30 355 851, brin inverseCD2BP2TBC1D10B : 30 357 102–30 370 529, brin inverseTBC1D10BMYL11 : 30 370 332–30 377 991, brin directMYL11ZNF48 : 30 378 106–30 400 108, brin directSEPTIN1 : 30 378 135–30 395 991, brin inverseSEPTIN1ZNF771 : 30 407 143–30 431 108, brin directDCTPP1 : 30 413 033–30 430 162, brin inverseSEPHS2 : 30 443 631–30 445 874, brin inverseSEPHS2ITGAL : 30 472 658–30 523 567, brin directITGALZNF768 : 30 524 001–30 527 328, brin inverseZNF768 : 30 525 923–30 534 852, brin inverseZNF747 : 30 529 534–30 535 347, brin inverseZNF747ZNF764 : 30 553 764–30 558 524, brin inverseZNF688 : 30 569 281–30 572 734, brin inverseZNF688ZNF785 : 30 573 740–30 585 806, brin inverseZNF689 : 30 602 558–30 624 012, brin inverseZNF689Schéma de GDPD3 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome 16Exon 10 : 30 104 810–30 105 009, 200 basesExon 9 : 30 108 213–30 108 264, 52 basesExon 8 : 30 108 373–30 108 432, 60 basesExon 7 : 30 111 388–30 111 521, 134 basesExon 6 : 30 112 132–30 112 221, 90 basesExon 5 : 30 112 306–30 112 424, 119 basesExon 4 : 30 112 523–30 112 568, 46 basesExon 3 : 30 112 658–30 112 793, 136 basesExon 2 : 30 113 022–30 113 064, 43 basesExon 1 : 30 113 340–30 113 537, 198 bases109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,1 kb sur les 8,7 kb du gène ; 957 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène GDPD3 : glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gdpd3

Vancouver

Dante Labs. Gène GDPD3 : glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gdpd3

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