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Gène

ASPHD1

aspartate beta-hydroxylase domain containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
16p11.2
Coordonnées
Chromosome 16 : 29 900 488–29 906 056 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 5,6 kb
Protéine
390 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000308748.10NM_181718.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ASPHD1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ASPHD1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de ASPHD1. ASPHD1 et 44 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 29 403 272 à 30 403 271.Chromosome 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329,6 Mb29,8 Mb30 Mb30,2 Mb30,4 MbNPIPB11 : 29 381 310–29 406 711, brin inverseBOLA2-SMG1P6 : 29 443 230–29 454 651, brin inverseBOLA2 : 29 453 587–29 455 012, brin inverseBOLA2SLX1B : 29 454 501–29 458 223, brin directSLX1BSULT1A4 : 29 458 993–29 464 979, brin directSULT1A4NPIPB12 : 29 483 534–29 508 595, brin inverseNPIPB12QPRT : 29 662 957–29 698 704, brin directQPRTSPN : 29 662 957–29 670 876, brin directSPNC16orf54 : 29 742 463–29 746 079, brin inverseC16orf54ZG16 : 29 760 591–29 783 885, brin directZG16KIF22 : 29 790 137–29 805 388, brin directMAZ : 29 805 637–29 811 176, brin directPRRT2 : 29 811 382–29 815 892, brin direct : 29 812 261–29 820 092, brin directPAGR1 : 29 816 086–29 822 489, brin directPAGR1 : 29 817 239–29 830 627, brin directMVP : 29 820 394–29 848 039, brin directMVPCDIPT : 29 857 474–29 863 414, brin inverseCDIPTSEZ6L2 : 29 871 159–29 899 582, brin inverseSEZ6L2ASPHD1 : 29 900 488–29 906 056, brin directASPHD1KCTD13 : 29 903 877–29 926 236, brin inverseKCTD13TMEM219 : 29 940 885–29 973 052, brin directTMEM219TAOK2 : 29 973 675–29 992 262, brin directTAOK2HIRIP3 : 29 992 314–29 996 126, brin inverseHIRIP3INO80E : 29 994 983–30 005 794, brin directINO80EDOC2A : 30 005 507–30 023 270, brin inverseFIMP1 : 30 023 198–30 027 736, brin directFIMP1TLCD3B : 30 024 425–30 052 978, brin inverse : 30 053 101–30 071 526, brin directALDOA : 30 064 164–30 070 457, brin directALDOAPPP4C : 30 075 967–30 085 391, brin directPPP4CTBX6 : 30 085 793–30 091 933, brin inverseTBX6YPEL3 : 30 092 314–30 096 915, brin inverseGDPD3 : 30 104 810–30 114 034, brin inverseMAPK3 : 30 114 104–30 123 506, brin inverseCORO1A : 30 182 798–30 189 085, brin directCORO1ABOLA2B : 30 192 928–30 194 306, brin inverseBOLA2BSLX1A : 30 193 875–30 197 566, brin directSLX1ASULT1A3 : 30 198 059–30 204 324, brin directSULT1A3NPIPB13 : 30 222 893–30 255 268, brin inverseCD2BP2 : 30 341 365–30 355 851, brin inverseCD2BP2TBC1D10B : 30 357 102–30 370 529, brin inverseTBC1D10BMYL11 : 30 370 332–30 377 991, brin directMYL11ZNF48 : 30 378 106–30 400 108, brin directSEPTIN1 : 30 378 135–30 395 991, brin inverseSEPTIN1Schéma de ASPHD1 : 3 exons sur le brin direct du chromosome 16Exon 1 : 29 900 488–29 901 920, 1 433 basesExon 2 : 29 904 852–29 904 965, 114 basesExon 3 : 29 905 788–29 906 056, 269 bases1235′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,8 kb sur les 5,6 kb du gène ; 1 173 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène ASPHD1 : aspartate beta-hydroxylase domain containing 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/asphd1

Vancouver

Dante Labs. Gène ASPHD1 : aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/asphd1

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