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Gène

BIN2

bridging integrator 2

Résumé

Localisation cytogénétique
12q13.13
Coordonnées
Chromosome 12 : 51 281 038–51 324 174 (GRCh38)
Exons
13 exons sur 43,1 kb
Protéine
565 acides aminés
Aussi appelé
BRAP-1
Transcrit MANE Select
ENST00000615107.6NM_016293.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore BIN2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de BIN2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de BIN2. BIN2 et 16 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 50 802 606 à 51 802 605.Chromosome 1212q13.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3351 Mb51,2 Mb51,4 Mb51,6 Mb51,8 MbATF1 : 50 763 710–50 821 162, brin directATF1TMPRSS12 : 50 842 920–50 887 884, brin directTMPRSS12TMT1A : 50 923 472–50 932 510, brin directTMT1A : 50 924 969–50 970 700, brin directSLC11A2 : 50 952 060–51 028 566, brin inverseSLC11A2HIGD1C : 50 952 538–50 970 860, brin directHIGD1CLETMD1 : 51 047 962–51 068 961, brin directLETMD1CSRNP2 : 51 061 205–51 083 664, brin inverseCSRNP2TFCP2 : 51 093 656–51 173 137, brin inverseTFCP2POU6F1 : 51 186 936–51 218 086, brin inversePOU6F1DAZAP2 : 51 238 724–51 272 164, brin directDAZAP2SMAGP : 51 244 558–51 270 517, brin inverseSMAGPBIN2 : 51 281 038–51 324 174, brin inverseBIN2CELA1 : 51 328 442–51 346 804, brin inverseCELA1GALNT6 : 51 351 247–51 392 867, brin inverseGALNT6SLC4A8 : 51 391 317–51 515 763, brin directSLC4A8SCN8A : 51 590 266–51 812 864, brin directSCN8ASchéma de BIN2 : 13 exons sur le brin inverse du chromosome 12Exon 13 : 51 281 038–51 281 528, 491 basesExon 12 : 51 284 716–51 284 787, 72 basesExon 11 : 51 288 108–51 288 188, 81 basesExon 10 : 51 291 591–51 292 344, 754 basesExon 9 : 51 295 796–51 295 878, 83 basesExon 8 : 51 297 089–51 297 164, 76 basesExon 7 : 51 299 203–51 299 288, 86 basesExon 6 : 51 299 607–51 299 714, 108 basesExon 5 : 51 302 020–51 302 115, 96 basesExon 4 : 51 302 686–51 302 780, 95 basesExon 3 : 51 303 087–51 303 141, 55 basesExon 2 : 51 313 823–51 313 903, 81 basesExon 1 : 51 324 022–51 324 174, 153 bases131210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,2 kb sur les 43,1 kb du gène ; 1 698 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de BIN2

4Facile

Difficulté de séquençage de BIN2 avec des lectures courtes, sur 100

Almost all of BIN2's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of BIN2's exons in each kind of hard region

  • Mappabilité8,4 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions1,4 %
  • Teneur en GC6,9 %
  • Couverture de la référence0 %

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène BIN2 : bridging integrator 2. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/bin2

Vancouver

Dante Labs. Gène BIN2 : bridging integrator 2 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/bin2

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