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Gène

ATF1

activating transcription factor 1

Résumé

Localisation cytogénétique
12q13.12
Coordonnées
Chromosome 12 : 50 764 101–50 821 162 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 57,1 kb
Protéine
271 acides aminés
Aussi appelé
TREB36
Transcrit MANE Select
ENST00000262053.8NM_005171.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ATF1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ATF1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de ATF1. ATF1 et 15 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 50 292 632 à 51 292 631.Chromosome 1212q13.12p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3350,4 Mb50,6 Mb50,8 Mb51 Mb51,2 MbFAM186A : 50 326 230–50 396 622, brin inverseFAM186ALARP4 : 50 392 383–50 480 007, brin directLARP4DIP2B : 50 504 962–50 748 657, brin directDIP2BATF1 : 50 764 101–50 821 162, brin directATF1TMPRSS12 : 50 842 920–50 887 884, brin directTMPRSS12TMT1A : 50 923 472–50 932 510, brin directTMT1A : 50 924 969–50 970 700, brin directSLC11A2 : 50 952 060–51 028 566, brin inverseSLC11A2HIGD1C : 50 952 538–50 970 860, brin directHIGD1CLETMD1 : 51 047 962–51 068 961, brin directLETMD1CSRNP2 : 51 061 205–51 083 664, brin inverseCSRNP2TFCP2 : 51 093 656–51 173 137, brin inverseTFCP2POU6F1 : 51 186 936–51 218 086, brin inversePOU6F1DAZAP2 : 51 238 724–51 272 164, brin directDAZAP2SMAGP : 51 244 558–51 270 517, brin inverseSMAGPBIN2 : 51 281 038–51 324 668, brin inverseBIN2Schéma de ATF1 : 7 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 1 : 50 764 101–50 764 307, 207 basesExon 2 : 50 780 140–50 780 238, 99 basesExon 3 : 50 795 909–50 796 009, 101 basesExon 4 : 50 809 456–50 809 589, 134 basesExon 5 : 50 814 010–50 814 192, 183 basesExon 6 : 50 814 280–50 814 439, 160 basesExon 7 : 50 819 635–50 821 162, 1 528 bases124675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,4 kb sur les 57,1 kb du gène ; 816 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène ATF1 : activating transcription factor 1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atf1

Vancouver

Dante Labs. Gène ATF1 : activating transcription factor 1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atf1

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