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Gène

LETMD1

LETM1 domain containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
12q13.12
Coordonnées
Chromosome 12 : 51 048 327–51 060 424 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 12,1 kb
Protéine
360 acides aminés
Aussi appelé
HCCR1, HCCR, HCCR-2, HCCR-1, HCCR2, SLC55A3
Transcrit MANE Select
ENST00000262055.9NM_015416.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LETMD1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LETMD1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de LETMD1. LETMD1 et 16 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 50 554 376 à 51 554 375.Chromosome 1212q13.12p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3350,6 Mb50,8 Mb51 Mb51,2 Mb51,4 MbDIP2B : 50 504 962–50 748 657, brin directDIP2BATF1 : 50 763 710–50 821 162, brin directATF1TMPRSS12 : 50 842 920–50 887 884, brin directTMPRSS12TMT1A : 50 923 472–50 932 510, brin directTMT1A : 50 924 969–50 970 700, brin directSLC11A2 : 50 952 060–51 028 566, brin inverseSLC11A2HIGD1C : 50 952 538–50 970 860, brin directHIGD1CLETMD1 : 51 048 327–51 060 424, brin directLETMD1CSRNP2 : 51 061 205–51 083 664, brin inverseCSRNP2TFCP2 : 51 093 656–51 173 137, brin inverseTFCP2POU6F1 : 51 186 936–51 218 086, brin inversePOU6F1DAZAP2 : 51 238 724–51 272 164, brin directDAZAP2SMAGP : 51 244 558–51 270 517, brin inverseSMAGPBIN2 : 51 281 038–51 324 668, brin inverseBIN2CELA1 : 51 328 442–51 346 804, brin inverseCELA1GALNT6 : 51 351 247–51 392 867, brin inverseGALNT6SLC4A8 : 51 391 317–51 515 763, brin directSLC4A8Schéma de LETMD1 : 9 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 1 : 51 048 327–51 048 478, 152 basesExon 2 : 51 049 034–51 049 185, 152 basesExon 3 : 51 052 092–51 052 207, 116 basesExon 4 : 51 053 778–51 053 860, 83 basesExon 5 : 51 055 835–51 056 021, 187 basesExon 6 : 51 056 144–51 056 245, 102 basesExon 7 : 51 056 350–51 056 502, 153 basesExon 8 : 51 058 032–51 058 128, 97 basesExon 9 : 51 059 361–51 060 424, 1 064 bases1234567895′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,1 kb sur les 12,1 kb du gène ; 1 083 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LETMD1 : LETM1 domain containing 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/letmd1

Vancouver

Dante Labs. Gène LETMD1 : LETM1 domain containing 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/letmd1

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