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Gène

ATG4A

autophagy related 4A cysteine peptidase

Résumé

Localisation cytogénétique
Xq22.3
Coordonnées
Chromosome X : 108 091 778–108 154 671 (GRCh38)
Exons
13 exons sur 62,9 kb
Protéine
398 acides aminés
Symboles précédents
AUTL2, APG4A
Transcrit MANE Select
ENST00000372232.8NM_052936.5
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ATG4A. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ATG4A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de ATG4A. ATG4A et 9 gènes à proximité sur le chromosome X, de 107 623 225 à 108 623 224.Chromosome XXq22.3p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28107,8 Mb108 Mb108,2 Mb108,4 Mb108,6 MbPRPS1 : 107 628 428–107 651 993, brin directPRPS1TSC22D3 : 107 713 221–107 777 342, brin inverseTSC22D3NCBP2L : 107 774 899–107 795 829, brin directNCBP2LMID2 : 107 825 730–107 931 637, brin directMID2TEX13B : 107 980 864–107 982 370, brin inverseTEX13BVSIG1 : 108 044 968–108 079 184, brin directVSIG1PSMD10 : 108 084 202–108 091 637, brin inversePSMD10ATG4A : 108 091 778–108 154 671, brin directATG4ACOL4A6 : 108 155 297–108 439 497, brin inverseCOL4A6COL4A5 : 108 439 717–108 697 766, brin directCOL4A5Schéma de ATG4A : 13 exons sur le brin direct du chromosome XExon 1 : 108 091 778–108 091 836, 59 basesExon 2 : 108 126 077–108 126 187, 111 basesExon 3 : 108 128 781–108 128 852, 72 basesExon 4 : 108 131 260–108 131 358, 99 basesExon 5 : 108 134 057–108 134 158, 102 basesExon 6 : 108 134 339–108 134 411, 73 basesExon 7 : 108 137 091–108 137 170, 80 basesExon 8 : 108 137 804–108 137 991, 188 basesExon 9 : 108 138 113–108 138 191, 79 basesExon 10 : 108 150 152–108 150 297, 146 basesExon 11 : 108 151 802–108 151 858, 57 basesExon 12 : 108 152 979–108 153 087, 109 basesExon 13 : 108 153 642–108 154 671, 1 030 bases1510135′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,2 kb sur les 62,9 kb du gène ; 1 197 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ATG4A : autophagy related 4A cysteine peptidase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atg4a

Vancouver

Dante Labs. Gène ATG4A : autophagy related 4A cysteine peptidase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atg4a

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