Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

ATG4A

autophagy related 4A cysteine peptidase

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
Xq22.3
Koordinater
Kromosom X: 108 091 778–108 154 671 (GRCh38)
Eksoner
13 eksoner over 62,9 kb
Protein
398 aminosyrer
Tidligere symboler
AUTL2, APG4A
MANE Select-transkripsjon
ENST00000372232.8NM_052936.5
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser ATG4A ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er ATG4A bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom X, med en parentes der ATG4A står. ATG4A og 9 gener i nærheten på kromosom X, fra 107 623 225 til 108 623 224.Kromosom XXq22.3p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28107,8 Mb108 Mb108,2 Mb108,4 Mb108,6 MbPRPS1: 107 628 428–107 651 993, fremover-strengPRPS1TSC22D3: 107 713 221–107 777 342, bakover-strengTSC22D3NCBP2L: 107 774 899–107 795 829, fremover-strengNCBP2LMID2: 107 825 730–107 931 637, fremover-strengMID2TEX13B: 107 980 864–107 982 370, bakover-strengTEX13BVSIG1: 108 044 968–108 079 184, fremover-strengVSIG1PSMD10: 108 084 202–108 091 637, bakover-strengPSMD10ATG4A: 108 091 778–108 154 671, fremover-strengATG4ACOL4A6: 108 155 297–108 439 497, bakover-strengCOL4A6COL4A5: 108 439 717–108 697 766, fremover-strengCOL4A5Diagram av ATG4A: 13 eksoner på fremover-strengen til kromosom XEkson 1: 108 091 778–108 091 836, 59 baserEkson 2: 108 126 077–108 126 187, 111 baserEkson 3: 108 128 781–108 128 852, 72 baserEkson 4: 108 131 260–108 131 358, 99 baserEkson 5: 108 134 057–108 134 158, 102 baserEkson 6: 108 134 339–108 134 411, 73 baserEkson 7: 108 137 091–108 137 170, 80 baserEkson 8: 108 137 804–108 137 991, 188 baserEkson 9: 108 138 113–108 138 191, 79 baserEkson 10: 108 150 152–108 150 297, 146 baserEkson 11: 108 151 802–108 151 858, 57 baserEkson 12: 108 152 979–108 153 087, 109 baserEkson 13: 108 153 642–108 154 671, 1 030 baser1510135′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 2,2 kb av genets 62,9 kb, og 1 197 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av ATG4A

14Moderat

Hvor vanskelig ATG4A er å sekvensere med korte leser, av 100

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi46 %
  • Repetisjoner1,4 %
  • GC-innhold0 %
  • Referansedekning0 %

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). ATG4A-genet: autophagy related 4A cysteine peptidase. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/atg4a

Vancouver

Dante Labs. ATG4A-genet: autophagy related 4A cysteine peptidase [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/atg4a

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test