Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

PCDHGB4

protocadherin gamma subfamily B, 4

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q31
Koordinaatit
Kromosomi 5: 141 387 698–141 512 975 (GRCh38)
Eksonit
4 eksonia 125,3 kb:n alueella
Proteiini
923 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FIB2, CDH20, PCDH-GAMMA-B4
MANE Select -transkripti
ENST00000519479.2NM_003736.4
Lokustyyppi
Muu
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä PCDHGB4. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

PCDHGB4-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa PCDHGB4-geenin sijainnin. PCDHGB4 ja 63 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 140 950 337–141 950 336.Kromosomi 55q31p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1: 140 786 136–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA2: 140 794 845–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA3: 140 801 018–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA4: 140 807 037–141 012 347, juoste eteenpäinPCDHA5: 140 821 599–141 012 347, juoste eteenpäinPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA11: 140 868 183–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA12: 140 875 256–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHA12PCDHA13: 140 882 079–141 012 347, juoste eteenpäinPCDHA13PCDHAC1: 140 926 299–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHAC1PCDHAC2: 140 966 466–141 012 351, juoste eteenpäinPCDHAC2PCDHB1: 141 051 374–141 059 346, juoste eteenpäinPCDHB1PCDHB2: 141 094 597–141 098 703, juoste eteenpäinPCDHB3: 141 100 473–141 103 827, juoste eteenpäinPCDHB3PCDHB4: 141 121 818–141 125 623, juoste eteenpäinPCDHB4PCDHB5: 141 135 206–141 138 615, juoste eteenpäinPCDHB5PCDHB6: 141 150 057–141 153 287, juoste eteenpäinPCDHB6PCDHB7: 141 172 644–141 176 383, juoste eteenpäinPCDHB8: 141 177 790–141 182 369, juoste eteenpäinPCDHB8PCDHB16: 141 182 387–141 186 226, juoste eteenpäinPCDHB9: 141 187 127–141 191 541, juoste eteenpäinPCDHB10: 141 192 353–141 195 647, juoste eteenpäinPCDHB11: 141 199 610–141 203 779, juoste eteenpäinPCDHB12: 141 208 697–141 212 571, juoste eteenpäinPCDHB13: 141 213 919–141 218 979, juoste eteenpäinPCDHB13PCDHB14: 141 223 343–141 227 759, juoste eteenpäinPCDHB14: 141 223 372–141 245 861, juoste eteenpäinPCDHB15: 141 245 395–141 249 365, juoste eteenpäinPCDHB15TAF7: 141 259 884–141 320 784, juoste taaksepäinTAF7SLC25A2: 141 302 635–141 304 049, juoste taaksepäinSLC25A2PCDHGA1: 141 330 495–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA2: 141 338 754–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA3: 141 343 819–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGB1: 141 350 083–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA4: 141 355 004–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGB2: 141 359 971–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA5: 141 364 162–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGB3: 141 370 237–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA6: 141 373 878–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA7: 141 382 702–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA7PCDHGB4: 141 387 698–141 512 975, juoste eteenpäinPCDHGB4PCDHGA8: 141 390 157–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA8PCDHGB5: 141 397 942–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGB5PCDHGA9: 141 402 765–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGB6: 141 407 989–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA10: 141 412 981–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGB7: 141 417 642–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA11: 141 421 021–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGA12: 141 430 507–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGC3: 141 475 929–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGC4: 141 484 997–141 512 977, juoste eteenpäinPCDHGC5: 141 489 067–141 512 977, juoste eteenpäinDIAPH1: 141 515 016–141 619 194, juoste taaksepäinHDAC3: 141 620 766–141 637 304, juoste taaksepäinHDAC3RELL2: 141 636 950–141 641 065, juoste eteenpäinRELL2FCHSD1: 141 639 296–141 651 430, juoste taaksepäinFCHSD1ARAP3: 141 653 204–141 682 255, juoste taaksepäinARAP3PCDH1: 141 853 090–141 879 246, juoste taaksepäinPCDH1DELE1: 141 923 800–141 952 031, juoste eteenpäinDELE1PCDH12: 141 943 581–141 969 741, juoste taaksepäinPCDH12PCDHGB4-kaavio: 4 eksonia kromosomin 5 juosteella, eteenpäinEkson 1: 141 387 698–141 390 281, 2 584 emästäEkson 2: 141 494 807–141 494 865, 59 emästäEkson 3: 141 505 393–141 505 481, 89 emästäEkson 4: 141 510 947–141 512 975, 2 029 emästä12345′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 125,3 kb:stä; 2 772 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

PCDHGB4-geenin sekvensointi

14Helppo

Kuinka vaikea PCDHGB4-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki PCDHGB4-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa PCDHGB4-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus11 %
  • Homologia0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot1,5 %
  • GC-pitoisuus13 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). PCDHGB4-geeni: protocadherin gamma subfamily B, 4. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pcdhgb4

Vancouver

Dante Labs. PCDHGB4-geeni: protocadherin gamma subfamily B, 4 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pcdhgb4

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test