Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

PABPC1L

poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
20q13.12
Koordinaatit
Kromosomi 20: 44 910 060–44 939 316 (GRCh38)
Eksonit
15 eksonia 29,3 kb:n alueella
Proteiini
619 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
dJ1069P2.3, PABPC1L1, ePAB
Aiemmat symbolit
C20orf119
MANE Select -transkripti
ENST00000217073.7NM_001372179.1
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä PABPC1L. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

PABPC1L-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 20, jossa hakasulke osoittaa PABPC1L-geenin sijainnin. PABPC1L ja 26 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 20, välillä 44 424 688–45 424 687.Kromosomi 2020q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3344,6 Mb44,8 Mb45 Mb45,2 Mb45,4 MbHNF4A: 44 355 439–44 432 845, juoste eteenpäinHNF4ATTPAL: 44 470 527–44 494 604, juoste eteenpäinTTPALSERINC3: 44 494 494–44 522 110, juoste taaksepäinSERINC3PKIG: 44 531 748–44 624 819, juoste eteenpäinPKIGADA: 44 584 896–44 652 252, juoste taaksepäinADACCN5: 44 714 270–44 728 731, juoste eteenpäinCCN5KCNK15: 44 745 785–44 752 677, juoste eteenpäinKCNK15RIMS4: 44 751 808–44 810 556, juoste taaksepäinRIMS4YWHAB: 44 885 676–44 908 715, juoste eteenpäinYWHABPABPC1L: 44 910 060–44 939 316, juoste eteenpäinPABPC1LTOMM34: 44 942 130–44 960 449, juoste taaksepäinTOMM34STK4: 44 966 474–45 084 214, juoste eteenpäinSTK4KCNS1: 45 091 214–45 101 188, juoste taaksepäinKCNS1WFDC5: 45 109 452–45 115 217, juoste taaksepäinWFDC5WFDC12: 45 123 425–45 124 465, juoste taaksepäinWFDC12PI3: 45 174 901–45 176 544, juoste eteenpäinPI3SEMG1: 45 206 973–45 210 605, juoste eteenpäinSEMG1SEMG2: 45 221 373–45 224 462, juoste eteenpäinSEMG2SLPI: 45 251 638–45 254 568, juoste taaksepäinSLPIMATN4: 45 293 445–45 312 469, juoste taaksepäinMATN4RBPJL: 45 306 840–45 317 824, juoste eteenpäinRBPJLSDC4: 45 325 288–45 348 433, juoste taaksepäinSDC4SYS1: 45 359 977–45 376 798, juoste eteenpäinSYS1SYS1-DBNDD2: 45 363 200–45 410 610, juoste eteenpäinSYS1-DBNDD2TP53TG5: 45 371 804–45 407 889, juoste taaksepäinTP53TG5DBNDD2: 45 405 616–45 410 870, juoste eteenpäinDBNDD2PIGT: 45 416 084–45 456 934, juoste eteenpäinPIGTPABPC1L-kaavio: 15 eksonia kromosomin 20 juosteella, eteenpäinEkson 1: 44 910 060–44 910 336, 277 emästäEkson 2: 44 912 660–44 912 853, 194 emästäEkson 3: 44 916 756–44 916 871, 116 emästäEkson 4: 44 918 906–44 919 045, 140 emästäEkson 5: 44 919 183–44 919 277, 95 emästäEkson 6: 44 921 594–44 921 731, 138 emästäEkson 7: 44 924 161–44 924 256, 96 emästäEkson 8: 44 930 460–44 930 726, 267 emästäEkson 9: 44 932 342–44 932 432, 91 emästäEkson 10: 44 933 057–44 933 185, 129 emästäEkson 11: 44 935 391–44 935 497, 107 emästäEkson 12: 44 936 637–44 936 730, 94 emästäEkson 13: 44 938 061–44 938 191, 131 emästäEkson 14: 44 938 674–44 938 748, 75 emästäEkson 15: 44 939 126–44 939 316, 191 emästä1510155′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,1 kb geenin 29,3 kb:stä; 1 860 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: PABPC1L

2Matala

Kuinka vaikea PABPC1L on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot0,1 %
  • GC-pitoisuus21 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Geeniin PABPC1L liittyvät piirteet

Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PABPC1L voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). PABPC1L-geeni: poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pabpc1l

Vancouver

Dante Labs. PABPC1L-geeni: poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pabpc1l

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test