Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

NKX2-8

NK2 homeobox 8

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
14q13.3
Koordinaatit
Kromosomi 14: 36 580 004–36 582 614 (GRCh38)
Eksonit
2 eksonia 2,6 kb:n alueella
Proteiini
239 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
NKX2.8, Nkx2-9
Aiemmat symbolit
NKX2H
MANE Select -transkripti
ENST00000258829.6NM_014360.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä NKX2-8. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

NKX2-8-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 14, jossa hakasulke osoittaa NKX2-8-geenin sijainnin. NKX2-8 ja 5 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 14, välillä 36 081 309–37 081 308.Kromosomi 1414q13.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3336,2 Mb36,4 Mb36,6 Mb36,8 Mb37 MbMBIP: 36 298 231–36 320 680, juoste taaksepäinMBIPSFTA3: 36 473 207–36 521 149, juoste taaksepäinSFTA3NKX2-1: 36 516 392–36 521 149, juoste taaksepäinNKX2-1NKX2-8: 36 580 004–36 582 614, juoste taaksepäinNKX2-8PAX9: 36 657 568–36 679 362, juoste eteenpäinPAX9SLC25A21: 36 677 921–37 172 743, juoste taaksepäinSLC25A21NKX2-8-kaavio: 2 eksonia kromosomin 14 juosteella, taaksepäinEkson 2: 36 580 004–36 581 464, 1 461 emästäEkson 1: 36 582 233–36 582 614, 382 emästä215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,8 kb geenin 2,6 kb:stä; 720 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

NKX2-8-geenin sekvensointi

16Kohtalainen

Kuinka vaikea NKX2-8-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Osa NKX2-8-geenin eksoneista sijaitsee kohdissa, joissa lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa NKX2-8-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot5,1 %
  • GC-pitoisuus76 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). NKX2-8-geeni: NK2 homeobox 8. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nkx2-8

Vancouver

Dante Labs. NKX2-8-geeni: NK2 homeobox 8 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nkx2-8

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test