Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

NFATC4

nuclear factor of activated T cells 4

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
14q12
Koordinaatit
Kromosomi 14: 24 368 184–24 379 601 (GRCh38)
Eksonit
10 eksonia 11,4 kb:n alueella
Proteiini
902 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
NFAT3
MANE Select -transkripti
ENST00000250373.9NM_004554.5
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä NFATC4. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

NFATC4-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 14, jossa hakasulke osoittaa NFATC4-geenin sijainnin. NFATC4 ja 45 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 14, välillä 23 873 893–24 873 892.Kromosomi 1414q12p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3324 Mb24,2 Mb24,4 Mb24,6 Mb24,8 MbDHRS4: 23 953 713–23 969 279, juoste eteenpäinDHRS4DHRS4L2: 23 969 874–24 006 408, juoste eteenpäinDHRS4L2CARMIL3: 24 051 387–24 069 734, juoste eteenpäinCARMIL3CPNE6: 24 070 837–24 078 100, juoste eteenpäinCPNE6NRL: 24 078 662–24 115 026, juoste taaksepäinPCK2: 24 094 053–24 110 598, juoste eteenpäinPCK2DCAF11: 24 114 010–24 125 615, juoste eteenpäin: 24 120 956–24 131 829, juoste eteenpäinFITM1: 24 130 659–24 132 849, juoste eteenpäinPSME1: 24 136 142–24 138 967, juoste eteenpäinEMC9: 24 138 958–24 142 023, juoste taaksepäinEMC9PSME2: 24 143 360–24 147 570, juoste taaksepäinRNF31: 24 146 683–24 160 660, juoste eteenpäinRNF31: 24 147 548–24 166 452, juoste eteenpäinIRF9: 24 161 101–24 168 043, juoste eteenpäinREC8: 24 171 853–24 180 923, juoste eteenpäinIPO4: 24 180 043–24 188 990, juoste taaksepäinIPO4: 24 180 395–24 190 416, juoste taaksepäinTM9SF1: 24 189 140–24 196 287, juoste taaksepäin: 24 189 157–24 213 473, juoste taaksepäinTSSK4: 24 205 696–24 208 362, juoste eteenpäinCHMP4A: 24 209 581–24 213 830, juoste taaksepäinMDP1: 24 213 939–24 216 070, juoste taaksepäinNEDD8-MDP1: 24 213 955–24 232 352, juoste taaksepäinNEDD8: 24 216 802–24 232 539, juoste taaksepäinNEDD8GMPR2: 24 232 211–24 239 246, juoste eteenpäinGMPR2TINF2: 24 234 009–24 242 666, juoste taaksepäinTINF2TGM1: 24 249 114–24 264 432, juoste taaksepäinTGM1RABGGTA: 24 265 468–24 271 620, juoste taaksepäinDHRS1: 24 290 594–24 300 136, juoste taaksepäinNOP9: 24 299 825–24 309 124, juoste eteenpäinCIDEB: 24 305 187–24 311 454, juoste taaksepäinLTB4R2: 24 305 734–24 312 053, juoste eteenpäinLTB4R2LTB4R: 24 311 188–24 318 036, juoste eteenpäinLTB4RADCY4: 24 318 091–24 335 208, juoste taaksepäinADCY4RIPK3: 24 336 025–24 340 022, juoste taaksepäinRIPK3NFATC4: 24 368 184–24 379 601, juoste eteenpäinNFATC4NYNRIN: 24 398 861–24 419 304, juoste eteenpäinNYNRINKHNYN: 24 423 052–24 441 846, juoste eteenpäinKHNYNCBLN3: 24 423 886–24 430 972, juoste taaksepäinCBLN3SDR39U1: 24 439 651–24 442 905, juoste taaksepäinSDR39U1CMA1: 24 505 353–24 508 271, juoste taaksepäinCMA1CTSG: 24 573 518–24 576 250, juoste taaksepäinCTSGGZMH: 24 606 480–24 609 821, juoste taaksepäinGZMHGZMB: 24 630 954–24 634 277, juoste taaksepäinGZMBSTXBP6: 24 809 454–25 050 333, juoste taaksepäinSTXBP6NFATC4-kaavio: 10 eksonia kromosomin 14 juosteella, eteenpäinEkson 1: 24 368 184–24 368 440, 257 emästäEkson 2: 24 369 499–24 370 594, 1 096 emästäEkson 3: 24 372 441–24 372 603, 163 emästäEkson 4: 24 373 171–24 373 370, 200 emästäEkson 5: 24 373 695–24 373 867, 173 emästäEkson 6: 24 374 326–24 374 466, 141 emästäEkson 7: 24 375 660–24 375 715, 56 emästäEkson 8: 24 375 975–24 376 101, 127 emästäEkson 9: 24 376 294–24 376 878, 585 emästäEkson 10: 24 377 638–24 379 601, 1 964 emästä123456789105′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 11,4 kb:stä; 2 709 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

NFATC4-geenin sekvensointi

6Helppo

Kuinka vaikea NFATC4-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki NFATC4-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa NFATC4-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot3,4 %
  • GC-pitoisuus26 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). NFATC4-geeni: nuclear factor of activated T cells 4. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nfatc4

Vancouver

Dante Labs. NFATC4-geeni: nuclear factor of activated T cells 4 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nfatc4

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test