Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

GTF2H2C

GTF2H2 family member C

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q13.2
Koordinaatit
Kromosomi 5: 69 560 191–69 595 221 (GRCh38)
Eksonit
17 eksonia 35 kb:n alueella
Proteiini
395 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000380729.8NM_001376000.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä GTF2H2C. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

GTF2H2C-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa GTF2H2C-geenin sijainnin. GTF2H2C ja 15 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 69 077 706–70 077 705.Kromosomi 55q13.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.369,2 Mb69,4 Mb69,6 Mb69,8 Mb70 MbSLC30A5: 69 093 917–69 156 940, juoste eteenpäinSLC30A5CCNB1: 69 167 004–69 178 389, juoste eteenpäinCCNB1CENPH: 69 189 537–69 210 357, juoste eteenpäinCENPHKGD4: 69 217 712–69 231 410, juoste eteenpäinKGD4CDK7: 69 234 550–69 277 495, juoste eteenpäinCDK7CCDC125: 69 279 859–69 332 828, juoste taaksepäinCCDC125AK6: 69 333 643–69 370 026, juoste taaksepäinAK6TAF9: 69 362 026–69 370 026, juoste taaksepäinTAF9RAD17: 69 369 293–69 414 806, juoste eteenpäinRAD17MARVELD2: 69 415 065–69 444 330, juoste eteenpäinMARVELD2OCLN: 69 492 184–69 558 114, juoste eteenpäinOCLNGTF2H2C: 69 560 191–69 595 221, juoste eteenpäinGTF2H2C: 69 632 080–69 636 399, juoste eteenpäin: 69 898 769–69 903 085, juoste taaksepäinSERF1B: 70 025 241–70 043 113, juoste eteenpäinSERF1BSMN2: 70 049 635–70 078 522, juoste eteenpäinSMN2GTF2H2C-kaavio: 17 eksonia kromosomin 5 juosteella, eteenpäinEkson 1: 69 560 191–69 560 403, 213 emästäEkson 2: 69 562 673–69 562 770, 98 emästäEkson 3: 69 565 100–69 565 188, 89 emästäEkson 4: 69 566 131–69 566 208, 78 emästäEkson 5: 69 566 589–69 566 625, 37 emästäEkson 6: 69 566 967–69 567 053, 87 emästäEkson 7: 69 567 727–69 567 777, 51 emästäEkson 8: 69 568 153–69 568 207, 55 emästäEkson 9: 69 572 445–69 572 550, 106 emästäEkson 10: 69 578 712–69 578 802, 91 emästäEkson 11: 69 579 021–69 579 108, 88 emästäEkson 12: 69 579 757–69 579 864, 108 emästäEkson 13: 69 582 366–69 582 429, 64 emästäEkson 14: 69 585 594–69 585 697, 104 emästäEkson 15: 69 586 254–69 586 356, 103 emästäEkson 16: 69 590 328–69 590 367, 40 emästäEkson 17: 69 592 079–69 595 221, 3 143 emästä1246810121416175′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,6 kb geenin 35 kb:stä; 1 188 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

GTF2H2C-geenin sekvensointi

100Vaikea

Kuinka vaikea GTF2H2C-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Suuri osa GTF2H2C-geenistä sijaitsee kohdissa, joissa lyhyt luenta voi jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa GTF2H2C-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus100 %
  • Homologia100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot5,1 %
  • GC-pitoisuus21 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). GTF2H2C-geeni: GTF2H2 family member C. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gtf2h2c

Vancouver

Dante Labs. GTF2H2C-geeni: GTF2H2 family member C [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gtf2h2c

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test