Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

TVP23C

trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
17p12
Koordinaadid
Kromosoom 17: 15 536 980–15 563 483 (GRCh38)
Eksonid
6 eksonit, ulatus 26,5 kb
Valk
203 aminohapet
Tuntud ka kui
MGC8763
Varasemad tähised
FAM18B2
MANE Select transkript
ENST00000518321.6NM_001135036.2
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni TVP23C veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas TVP23C on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 17, millel on sulg kohal, kus asub TVP23C. TVP23C ja sellele lähedal asuvad 14 geeni kromosoomil 17, vahemikus 15 050 232 kuni 16 050 231.Kromosoom 1717p12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.315,2 Mb15,4 Mb15,6 Mb15,8 Mb16 MbPMP22: 15 176 316–15 272 292, pöördne ahelPMP22TEKT3: 15 303 811–15 341 632, pöördne ahelTEKT3CDRT4: 15 433 937–15 475 733, pöördne ahelCDRT4TVP23C-CDRT4: 15 436 021–15 563 561, pöördne ahelTVP23C-CDRT4TVP23C: 15 536 980–15 563 483, pöördne ahelTVP23CFBXW10B: 15 565 484–15 619 704, pöördne ahelFBXW10B: 15 571 491–15 651 653, pöördne ahelTRIM16: 15 627 950–15 684 311, pöördne ahelTRIM16ZNF286A-TBC1D26: 15 699 552–15 745 940, otsene ahelZNF286A-TBC1D26ZNF286A: 15 699 577–15 720 787, otsene ahelZNF286ATBC1D26: 15 732 247–15 746 162, otsene ahelTBC1D26ADORA2B: 15 945 093–15 976 467, otsene ahelADORA2BZSWIM7: 15 976 219–15 999 717, pöördne ahelZSWIM7TTC19: 15 999 386–16 068 416, otsene ahelTTC19NCOR1: 16 029 065–16 218 185, pöördne ahelNCOR1TVP23C skeem: 6 eksonit kromosoomi 17 pöördne ahelalEkson 6: 15 536 980–15 540 561, 3582 alustEkson 5: 15 545 785–15 545 916, 132 alustEkson 4: 15 547 059–15 547 148, 90 alustEkson 3: 15 553 685–15 553 829, 145 alustEkson 2: 15 555 282–15 555 364, 83 alustEkson 1: 15 563 437–15 563 483, 47 alust6543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,1 kb kogupikkusega 26,5 kb; neist 612 alust kodeerivad valku.

TVP23C sekveneerimine

85Raske

Kui raske on geeni TVP23C lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Suur osa geenist TVP23C asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni TVP23C eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus62%
  • Homoloogia100%
  • Shared with chrY0%
  • Referentsi katvus0%
  • Kordused4,3%
  • GC-sisaldus7,3%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). TVP23C geen: trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tvp23c

Vancouver

Dante Labs. TVP23C geen: trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tvp23c

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test