Geen
ST3GAL6
ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6
- HGNC 18080↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000064225↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 10402↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 3q12.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 3: 98 763 340–98 795 852 (GRCh38)
- Eksonid
- 10 eksonit, ulatus 32,5 kb
- Valk
- 331 aminohapet
- Tuntud ka kui
- ST3GALVI
- Varasemad tähised
- SIAT10
- MANE Select transkript
- ENST00000483910.6NM_001323368.2
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/st3gal6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe ST3GAL6 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ST3GAL6 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas ST3GAL6 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,2 kb kogupikkusega 32,5 kb; neist 996 alust kodeerivad valku.
ST3GAL6 sekveneerimine
1Kerge
Kui raske on geeni ST3GAL6 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st
0 · Kerge100 · Raske
Peaaegu kõik geeni ST3GAL6 eksonid asuvad kohtades, kus lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.
Mis seda veel suurendab: geeni ST3GAL6 eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal muutus puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: genoomis mujal asuvad koopiad, nagu paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KorduvusedTandemkorduvused ja ühe aluse jadad, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.3,9%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-aluseid on alla 25% või üle 65%; raamatukogu valmistamine katab neid nõrgalt. Kaal 10%.6,4%
- ReferentskatvusReferentskoostu lüngad lähedal, kus pole järjestust, millega lugemid joonduda saaks. Kaal 10%.0%
Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakseIga riba näitab, kui suur osa geeni ST3GAL6 eksonite alustest jääb sellisesse raskesse piirkonda. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemite põhjal tehtavat tuvastust raskendab: 0, kui ükski alus ei asu ühessegi piirkonda, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ST3GAL6 geen: ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/st3gal6
Dante Labs. ST3GAL6 geen: ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/st3gal6
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast