Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

PPP1R7

protein phosphatase 1 regulatory subunit 7

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2q37.3
Koordinaadid
Kromosoom 2: 241 150 467–241 183 652 (GRCh38)
Eksonid
10 eksonit, ulatus 33,2 kb
Valk
360 aminohapet
Tuntud ka kui
sds22
MANE Select transkript
ENST00000234038.11NM_002712.3
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PPP1R7 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PPP1R7 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub PPP1R7. PPP1R7 ja sellele lähedal asuvad 17 geeni kromosoomil 2, vahemikus 240 667 060 kuni 241 667 059.Kromosoom 22q37.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3240,8 Mb241 Mb241,2 Mb241,4 Mb241,6 MbAQP12B: 240 676 418–240 682 906, pöördne ahelAQP12BAQP12A: 240 691 866–240 698 483, otsene ahelAQP12AKIF1A: 240 713 761–240 824 320, pöördne ahelKIF1AAGXT: 240 868 543–240 881 531, otsene ahelAGXTMAB21L4: 240 886 048–240 896 894, pöördne ahelMAB21L4CROCC2: 240 906 330–240 993 311, otsene ahelCROCC2SNED1: 240 998 612–241 095 579, otsene ahelSNED1MTERF4: 241 072 169–241 102 332, pöördne ahelMTERF4PASK: 241 106 094–241 150 852, pöördne ahelPASKPPP1R7: 241 150 467–241 183 652, otsene ahelPPP1R7ANO7: 241 188 509–241 227 338, otsene ahelANO7HDLBP: 241 227 264–241 317 061, pöördne ahelHDLBPSEPTIN2: 241 314 923–241 354 030, otsene ahelSEPTIN2FARP2: 241 356 244–241 494 847, otsene ahelFARP2STK25: 241 482 075–241 509 730, pöördne ahelSTK25BOK: 241 551 300–241 585 941, otsene ahelBOKTHAP4: 241 584 405–241 637 581, pöördne ahelTHAP4ATG4B: 241 637 204–241 673 857, otsene ahelATG4BPPP1R7 skeem: 10 eksonit kromosoomi 2 otsene ahelalEkson 1: 241 150 467–241 150 547, 81 alustEkson 2: 241 153 476–241 153 604, 129 alustEkson 3: 241 157 807–241 157 862, 56 alustEkson 4: 241 158 484–241 158 549, 66 alustEkson 5: 241 159 213–241 159 343, 131 alustEkson 6: 241 160 332–241 160 494, 163 alustEkson 7: 241 163 285–241 163 401, 117 alustEkson 8: 241 166 337–241 166 441, 105 alustEkson 9: 241 169 781–241 169 867, 87 alustEkson 10: 241 182 647–241 183 652, 1006 alust123456789105′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 33,2 kb; neist 1083 alust kodeerivad valku.

PPP1R7 sekveneerimine

2Lihtne

Kui raske on geeni PPP1R7 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni PPP1R7 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni PPP1R7 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referentsi katvus0%
  • Kordused0%
  • GC-sisaldus8,4%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PPP1R7 geen: protein phosphatase 1 regulatory subunit 7. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ppp1r7

Vancouver

Dante Labs. PPP1R7 geen: protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ppp1r7

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test