Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

FAM162A

family with sequence similarity 162 member A

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
3q21.1
Koordinaadid
Kromosoom 3: 122 384 182–122 412 334 (GRCh38)
Eksonid
5 eksonit, ulatus 28,2 kb
Valk
154 aminohapet
Tuntud ka kui
E2IG5, HGTD-P
Varasemad tähised
C3orf28
MANE Select transkript
ENST00000477892.5NM_014367.4
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni FAM162A veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas FAM162A on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 3, millel on sulg kohal, kus asub FAM162A. FAM162A ja sellele lähedal asuvad 14 geeni kromosoomil 3, vahemikus 121 898 258 kuni 122 898 257.Kromosoom 33q21.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29122 Mb122,2 Mb122,4 Mb122,6 Mb122,8 MbSLC15A2: 121 894 355–121 944 188, otsene ahelSLC15A2ILDR1: 121 987 322–122 022 282, pöördne ahelILDR1CD86: 122 055 356–122 121 557, otsene ahelCD86CASR: 122 183 665–122 291 629, otsene ahelCASRCSTA: 122 325 238–122 359 856, otsene ahelCSTAMIX23: 122 338 391–122 383 276, pöördne ahelMIX23FAM162A: 122 384 182–122 412 334, otsene ahelFAM162AWDR5B: 122 411 846–122 416 464, pöördne ahelWDR5BKPNA1: 122 421 902–122 514 955, pöördne ahelKPNA1PARP9: 122 527 910–122 565 478, pöördne ahelPARP9DTX3L: 122 564 228–122 575 203, otsene ahelDTX3LPARP15: 122 577 597–122 639 047, otsene ahelPARP15PARP14: 122 680 212–122 730 840, otsene ahelPARP14HSPBAP1: 122 719 877–122 795 035, pöördne ahelHSPBAP1SLC49A4: 122 794 819–122 881 144, otsene ahelSLC49A4FAM162A skeem: 5 eksonit kromosoomi 3 otsene ahelalEkson 1: 122 384 182–122 384 299, 118 alustEkson 2: 122 402 760–122 402 882, 123 alustEkson 3: 122 404 258–122 404 363, 106 alustEkson 4: 122 407 281–122 407 389, 109 alustEkson 5: 122 409 739–122 412 334, 2596 alust123455′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,1 kb kogupikkusega 28,2 kb; neist 465 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: FAM162A

1Lihtne

Kui raske on geeni FAM162A lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni FAM162A eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni FAM162A eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused1,4%
  • GC-sisaldus3,9%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). FAM162A geen: family with sequence similarity 162 member A. Vaadatud 20. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/fam162a

Vancouver

Dante Labs. FAM162A geen: family with sequence similarity 162 member A [Internet]. [viidatud 20. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/fam162a

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test