Geen
ARHGAP11B
Rho GTPase activating protein 11B
- HGNC 15782↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000285077↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 89839↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 15q13.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 15: 30 626 128–30 638 810 (GRCh38)
- Eksonid
- 7 eksonit, ulatus 12,7 kb
- Valk
- 267 aminohapet
- Tuntud ka kui
- B'-T
- Varasemad tähised
- FAM7B1
- MANE Select transkript
- ENST00000697964.2NM_001039841.3
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/arhgap11b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe ARHGAP11B ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ARHGAP11B veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas ARHGAP11B on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,6 kb kogupikkusega 12,7 kb; neist 804 alust kodeerivad valku.
ARHGAP11B sekveneerimine
38Raske
Kui raske on geeni ARHGAP11B lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st
0 · Kerge100 · Raske
Suur osa geenist ARHGAP11B asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.
Mis seda veel suurendab: geeni ARHGAP11B eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal muutus puududa või olla vale. Kaal 35%.100%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: genoomis mujal asuvad koopiad, nagu paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KorduvusedTandemkorduvused ja ühe aluse jadad, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.0,2%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-aluseid on alla 25% või üle 65%; raamatukogu valmistamine katab neid nõrgalt. Kaal 10%.26%
- ReferentskatvusReferentskoostu lüngad lähedal, kus pole järjestust, millega lugemid joonduda saaks. Kaal 10%.0%
Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakseIga riba näitab, kui suur osa geeni ARHGAP11B eksonite alustest jääb sellisesse raskesse piirkonda. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemite põhjal tehtavat tuvastust raskendab: 0, kui ükski alus ei asu ühessegi piirkonda, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ARHGAP11B geen: Rho GTPase activating protein 11B. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/arhgap11b
Dante Labs. ARHGAP11B geen: Rho GTPase activating protein 11B [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/arhgap11b
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast