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Gen

RAET1L

retinoic acid early transcript 1L

Resumen

Localización citogenética
6q25.1
Coordenadas
Cromosoma 6: 150.018.334–150.025.532 (GRCh38)
Exones
5 exones en 7,2 kb
Proteína
246 aminoácidos
Transcrito MANE Select
ENST00000367341.6NM_130900.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún RAET1L. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de RAET1L

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 6, con un corchete donde se ubica RAET1L. RAET1L y 15 genes cercanos en el cromosoma 6, desde 149.521.933 hasta 150.521.932.Cromosoma 66q25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27149,6 Mb149,8 Mb150 Mb150,2 Mb150,4 MbPPIL4: 149.501.435–149.546.111, hebra inversaPPIL4GINM1: 149.566.190–149.591.751, hebra directaGINM1KATNA1: 149.594.873–149.648.972, hebra inversaKATNA1LATS1: 149.658.153–149.718.261, hebra inversaLATS1NUP43: 149.723.373–149.750.286, hebra inversaNUP43PCMT1: 149.749.197–149.811.422, hebra directaPCMT1LRP11: 149.793.455–149.864.424, hebra inversaLRP11: 149.817.937–149.896.011, hebra inversaRAET1E: 149.882.982–149.898.118, hebra inversaRAET1ERAET1G: 149.915.593–149.923.126, hebra inversaRAET1GULBP2: 149.941.938–149.949.235, hebra directaULBP2ULBP1: 149.963.935–149.973.715, hebra directaULBP1RAET1L: 150.018.334–150.025.532, hebra inversaRAET1LULBP3: 150.057.438–150.069.191, hebra inversaULBP3PPP1R14C: 150.142.993–150.250.392, hebra directaPPP1R14CIYD: 150.368.892–150.405.969, hebra directaIYDDiagrama de RAET1L: 5 exones en la hebra inversa del cromosoma 6Exón 5: 150.018.334–150.018.855, 522 basesExón 4: 150.020.108–150.020.239, 132 basesExón 3: 150.020.905–150.021.186, 282 basesExón 2: 150.021.980–150.022.243, 264 basesExón 1: 150.025.387–150.025.532, 146 bases543215′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 1,3 kb de los 7,2 kb del gen; 741 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de RAET1L

77Difícil

Lo difícil que es secuenciar RAET1L con lecturas cortas, sobre 100

Gran parte de RAET1L se encuentra en zonas donde las lecturas cortas pueden pasar por alto o colocar mal un cambio.

Lo que suma: la proporción de los exones de RAET1L en cada tipo de región difícil

  • Mapeabilidad42 %
  • Homología100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Cobertura de referencia0 %
  • Repeticiones5,5 %
  • Contenido GC0 %

Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle, del NIST.Cómo se puntúa

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen RAET1L: retinoic acid early transcript 1L. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/raet1l

Vancouver

Dante Labs. Gen RAET1L: retinoic acid early transcript 1L [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/raet1l

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