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Gene

RAET1L

retinoic acid early transcript 1L

Resumo

Localização citogenética
6q25.1
Coordenadas
Cromossoma 6: 150 018 334–150 025 532 (GRCh38)
Exões
5 exões ao longo de 7,2 kb
Proteína
246 aminoácidos
Transcrito MANE Select
ENST00000367341.6NM_130900.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa RAET1L ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como RAET1L está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 6, com um parêntese onde se situa RAET1L. RAET1L e 15 genes próximos no cromossoma 6, de 149 521 933 a 150 521 932.Cromossoma 66q25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27149,6 Mb149,8 Mb150 Mb150,2 Mb150,4 MbPPIL4: 149 501 435–149 546 111, fita inversaPPIL4GINM1: 149 566 190–149 591 751, fita diretaGINM1KATNA1: 149 594 873–149 648 972, fita inversaKATNA1LATS1: 149 658 153–149 718 261, fita inversaLATS1NUP43: 149 723 373–149 750 286, fita inversaNUP43PCMT1: 149 749 197–149 811 422, fita diretaPCMT1LRP11: 149 793 455–149 864 424, fita inversaLRP11: 149 817 937–149 896 011, fita inversaRAET1E: 149 882 982–149 898 118, fita inversaRAET1ERAET1G: 149 915 593–149 923 126, fita inversaRAET1GULBP2: 149 941 938–149 949 235, fita diretaULBP2ULBP1: 149 963 935–149 973 715, fita diretaULBP1RAET1L: 150 018 334–150 025 532, fita inversaRAET1LULBP3: 150 057 438–150 069 191, fita inversaULBP3PPP1R14C: 150 142 993–150 250 392, fita diretaPPP1R14CIYD: 150 368 892–150 405 969, fita diretaIYDDiagrama de RAET1L: 5 exões na cadeia inversa do cromossoma 6Exão 5: 150 018 334–150 018 855, 522 basesExão 4: 150 020 108–150 020 239, 132 basesExão 3: 150 020 905–150 021 186, 282 basesExão 2: 150 021 980–150 022 243, 264 basesExão 1: 150 025 387–150 025 532, 146 bases543215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 1,3 kb dos 7,2 kb do gene; 741 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de RAET1L

77Difícil

Grau de dificuldade de sequenciar RAET1L com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Grande parte de RAET1L se situa em zonas onde as leituras curtas podem falhar ou posicionar mal uma alteração.

O que acresce: a proporção dos exões de RAET1L em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade42%
  • Homologia100%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições5,5%
  • Conteúdo em GC0%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene RAET1L: retinoic acid early transcript 1L. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/raet1l

Vancouver

Dante Labs. Gene RAET1L: retinoic acid early transcript 1L [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/raet1l

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