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Gen

RAET1L

retinoic acid early transcript 1L

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
6q25.1
Koordinaten
Chromosom 6: 150.018.334–150.025.532 (GRCh38)
Exons
5 Exons über 7,2 kb
Protein
246 Aminosäuren
MANE-Select-Transkript
ENST00000367341.6NM_130900.3
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet RAET1L bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von RAET1L

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 6, mit einer Klammer, an der RAET1L liegt. RAET1L und 15 Gene in der Nähe auf Chromosom 6, von 149.521.933 bis 150.521.932.Chromosom 66q25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27149,6 Mb149,8 Mb150 Mb150,2 Mb150,4 MbPPIL4: 149.501.435–149.546.111, Minus-StrangPPIL4GINM1: 149.566.190–149.591.751, Plus-StrangGINM1KATNA1: 149.594.873–149.648.972, Minus-StrangKATNA1LATS1: 149.658.153–149.718.261, Minus-StrangLATS1NUP43: 149.723.373–149.750.286, Minus-StrangNUP43PCMT1: 149.749.197–149.811.422, Plus-StrangPCMT1LRP11: 149.793.455–149.864.424, Minus-StrangLRP11: 149.817.937–149.896.011, Minus-StrangRAET1E: 149.882.982–149.898.118, Minus-StrangRAET1ERAET1G: 149.915.593–149.923.126, Minus-StrangRAET1GULBP2: 149.941.938–149.949.235, Plus-StrangULBP2ULBP1: 149.963.935–149.973.715, Plus-StrangULBP1RAET1L: 150.018.334–150.025.532, Minus-StrangRAET1LULBP3: 150.057.438–150.069.191, Minus-StrangULBP3PPP1R14C: 150.142.993–150.250.392, Plus-StrangPPP1R14CIYD: 150.368.892–150.405.969, Plus-StrangIYDDiagramm von RAET1L: 5 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 6Exon 5: 150.018.334–150.018.855, 522 BasenExon 4: 150.020.108–150.020.239, 132 BasenExon 3: 150.020.905–150.021.186, 282 BasenExon 2: 150.021.980–150.022.243, 264 BasenExon 1: 150.025.387–150.025.532, 146 Basen543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,3 kb der 7,2 kb des Gens aus; 741 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von RAET1L

46Schwer

Wie schwer sich RAET1L mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Ein großer Teil von RAET1L liegt in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Dazu kommt der Anteil der Exons von RAET1L in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability42 %
  • Homologie100 %
  • Wiederholungen5,5 %
  • GC-Gehalt0 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). RAET1L-Gen: retinoic acid early transcript 1L. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/raet1l

Vancouver

Dante Labs. RAET1L-Gen: retinoic acid early transcript 1L [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/raet1l

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