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Gen

ATP2C2

ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2

Resumen

Localización citogenética
16q24.1
Coordenadas
Cromosoma 16: 84.368.538–84.464.187 (GRCh38)
Exones
27 exones en 95,7 kb
Proteína
946 aminoácidos
También conocido como
KIAA0703, SPCA2
Transcrito MANE Select
ENST00000262429.9NM_014861.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún ATP2C2. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de ATP2C2

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 16, con un corchete donde se ubica ATP2C2. ATP2C2 y 17 genes cercanos en el cromosoma 16, desde 83.916.363 hasta 84.916.362.Cromosoma 1616q24.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.384 Mb84,2 Mb84,4 Mb84,6 Mb84,8 MbMLYCD: 83.899.057–83.951.445, hebra directaMLYCDOSGIN1: 83.931.311–83.966.333, hebra directaOSGIN1NECAB2: 83.968.244–84.002.776, hebra directaNECAB2SLC38A8: 84.009.558–84.043.143, hebra inversaSLC38A8MBTPS1: 84.052.703–84.116.966, hebra inversaMBTPS1: 84.101.970–84.101.996, hebra inversaHSDL1: 84.122.133–84.145.214, hebra inversaHSDL1DNAAF1: 84.145.261–84.178.769, hebra directaDNAAF1TAF1C: 84.177.846–84.187.070, hebra inversaTAF1CADAD2: 84.191.113–84.197.168, hebra directaADAD2KCNG4: 84.218.657–84.240.016, hebra inversaKCNG4WFDC1: 84.294.615–84.329.853, hebra directaWFDC1ATP2C2: 84.368.538–84.464.187, hebra directaATP2C2MEAK7: 84.476.345–84.565.284, hebra inversaMEAK7COTL1: 84.565.596–84.618.136, hebra inversaCOTL1KLHL36: 84.643.425–84.667.837, hebra directaKLHL36USP10: 84.699.942–84.779.926, hebra directaUSP10CRISPLD2: 84.819.975–84.920.768, hebra directaCRISPLD2Diagrama de ATP2C2: 27 exones en la hebra directa del cromosoma 16Exón 1: 84.368.538–84.368.714, 177 basesExón 2: 84.398.499–84.398.609, 111 basesExón 3: 84.405.128–84.405.244, 117 basesExón 4: 84.408.405–84.408.494, 90 basesExón 5: 84.410.568–84.410.603, 36 basesExón 6: 84.410.704–84.410.765, 62 basesExón 7: 84.415.483–84.415.591, 109 basesExón 8: 84.422.390–84.422.539, 150 basesExón 9: 84.422.629–84.422.697, 69 basesExón 10: 84.423.188–84.423.263, 76 basesExón 11: 84.425.735–84.425.801, 67 basesExón 12: 84.439.166–84.439.290, 125 basesExón 13: 84.439.427–84.439.524, 98 basesExón 14: 84.440.857–84.440.958, 102 basesExón 15: 84.442.510–84.442.599, 90 basesExón 16: 84.446.329–84.446.430, 102 basesExón 17: 84.448.533–84.448.689, 157 basesExón 18: 84.451.921–84.452.091, 171 basesExón 19: 84.453.138–84.453.235, 98 basesExón 20: 84.453.321–84.453.371, 51 basesExón 21: 84.454.818–84.454.984, 167 basesExón 22: 84.459.120–84.459.188, 69 basesExón 23: 84.459.270–84.459.386, 117 basesExón 24: 84.460.654–84.460.801, 148 basesExón 25: 84.461.714–84.461.812, 99 basesExón 26: 84.461.988–84.462.129, 142 basesExón 27: 84.463.614–84.464.187, 574 bases11020275′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 3,4 kb de los 95,7 kb del gen; 2841 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de ATP2C2

1Fácil

Qué tan difícil es secuenciar ATP2C2 con lecturas cortas, sobre 100

Casi todos los exones de ATP2C2 se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.

Lo que suma: la proporción de los exones de ATP2C2 en cada tipo de región difícil

  • Mapeabilidad0 %
  • Homología0 %
  • Repeticiones0,5 %
  • Contenido de GC11 %
  • Cobertura de referencia0 %

Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúa

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen ATP2C2: ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/atp2c2

Vancouver

Dante Labs. Gen ATP2C2: ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/atp2c2

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