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Gen

ZSWIM1

zinc finger SWIM-type containing 1

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
20q13.12
Koordinaten
Chromosom 20: 45.881.227–45.885.266 (GRCh38)
Exons
2 Exons über 4 kb
Protein
485 Aminosäuren
Auch bekannt als
dJ337O18.5
Frühere Symbole
C20orf162
MANE-Select-Transkript
ENST00000372523.1NM_080603.5
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet ZSWIM1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von ZSWIM1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 20, mit einer Klammer, an der ZSWIM1 liegt. ZSWIM1 und 36 Gene in der Nähe auf Chromosom 20, von 45.383.247 bis 46.383.246.Chromosom 2020q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3345,4 Mb45,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 MbSYS1-DBNDD2: 45.363.200–45.410.610, Plus-StrangSYS1-DBNDD2TP53TG5: 45.371.804–45.407.889, Minus-StrangTP53TG5DBNDD2: 45.405.616–45.410.870, Plus-StrangDBNDD2PIGT: 45.416.084–45.456.934, Plus-StrangPIGTWFDC2: 45.469.166–45.481.533, Plus-StrangWFDC2SPINT3: 45.512.461–45.515.622, Minus-StrangWFDC6: 45.533.091–45.539.496, Minus-StrangWFDC6EPPIN-WFDC6: 45.534.196–45.547.662, Minus-StrangEPPIN-WFDC6EPPIN: 45.540.626–45.547.786, Minus-StrangEPPINWFDC8: 45.551.153–45.579.326, Minus-StrangWFDC8WFDC9: 45.607.939–45.631.284, Minus-StrangWFDC9WFDC10A: 45.629.733–45.631.196, Plus-StrangWFDC10AWFDC11: 45.648.563–45.670.270, Minus-StrangWFDC11WFDC10B: 45.684.651–45.705.019, Minus-StrangWFDC10BWFDC13: 45.702.038–45.708.817, Plus-StrangWFDC13SPINT4: 45.722.347–45.725.830, Plus-StrangSPINT4WFDC3: 45.747.944–45.791.932, Minus-StrangWFDC3DNTTIP1: 45.791.937–45.811.427, Plus-StrangDNTTIP1UBE2C: 45.812.561–45.816.965, Plus-StrangUBE2CTNNC2: 45.823.214–45.833.745, Minus-StrangTNNC2SNX21: 45.833.633–45.843.276, Plus-StrangACOT8: 45.841.709–45.857.435, Minus-StrangZSWIM3: 45.857.591–45.879.131, Plus-StrangZSWIM1: 45.881.227–45.885.266, Plus-StrangZSWIM1SPATA25: 45.886.491–45.887.626, Minus-StrangSPATA25NEURL2: 45.888.002–45.891.220, Minus-StrangNEURL2CTSA: 45.890.144–45.898.949, Plus-StrangCTSAPLTP: 45.897.535–45.912.235, Minus-StrangPCIF1: 45.934.673–45.948.023, Plus-StrangZNF335: 45.948.653–45.972.358, Minus-StrangZNF335MMP9: 46.008.869–46.016.561, Plus-StrangMMP9SLC12A5: 46.021.675–46.060.150, Plus-StrangSLC12A5NCOA5: 46.060.984–46.089.973, Minus-StrangNCOA5CD40: 46.118.240–46.130.378, Plus-StrangCD40CDH22: 46.173.737–46.309.009, Minus-StrangCDH22SLC35H1: 46.345.980–46.364.460, Minus-StrangSLC35H1ELMO2: 46.366.045–46.432.985, Minus-StrangELMO2Diagramm von ZSWIM1: 2 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 20Exon 1: 45.881.227–45.881.261, 35 BasenExon 2: 45.882.533–45.885.266, 2.734 Basen125′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 2,8 kb der 4 kb des Gens aus; 1.458 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von ZSWIM1

5Leicht

Wie schwer sich ZSWIM1 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Nahezu alle Exons von ZSWIM1 liegen in Bereichen, in denen Short Reads sauber zugeordnet werden können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von ZSWIM1 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability2,2 %
  • Homologie0 %
  • Gemeinsam mit chrY0 %
  • Abdeckung der Referenz0 %
  • Wiederholungen4,1 %
  • GC-Gehalt7,2 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). ZSWIM1-Gen: zinc finger SWIM-type containing 1. Abgerufen am 19. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/zswim1

Vancouver

Dante Labs. ZSWIM1-Gen: zinc finger SWIM-type containing 1 [Internet]. [zitiert am 19. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/zswim1

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