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Gen

CD48

CD48 molecule

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
1q23.3
Koordinaten
Chromosom 1: 160.678.746–160.711.822 (GRCh38)
Exons
4 Exons über 33,1 kb
Protein
243 Aminosäuren
Auch bekannt als
BLAST, mCD48, hCD48, SLAMF2
Frühere Symbole
BCM1
MANE-Select-Transkript
ENST00000368046.8NM_001778.4
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet CD48 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von CD48

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 1, mit einer Klammer, an der CD48 liegt. CD48 und 32 Gene in der Nähe auf Chromosom 1, von 160.195.284 bis 161.195.283.Chromosom 11q23.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44160,2 Mb160,4 Mb160,6 Mb160,8 Mb161 MbCASQ1: 160.190.212–160.201.886, Plus-StrangCASQ1PEA15: 160.205.328–160.220.335, Plus-StrangPEA15DCAF8: 160.214.840–160.263.388, Minus-StrangDCAF8: 160.216.800–160.285.130, Minus-StrangPEX19: 160.266.229–160.286.348, Minus-StrangPEX19COPA: 160.288.580–160.343.566, Minus-StrangCOPANCSTN: 160.343.294–160.358.957, Plus-StrangNCSTNNHLH1: 160.367.071–160.372.846, Plus-StrangNHLH1VANGL2: 160.400.528–160.428.678, Plus-StrangVANGL2SLAMF6: 160.484.817–160.523.273, Minus-StrangSLAMF6CD84: 160.541.095–160.579.544, Minus-StrangCD84SLAMF1: 160.608.100–160.647.056, Minus-StrangSLAMF1CD48: 160.678.746–160.711.822, Minus-StrangCD48SLAMF7: 160.739.057–160.754.821, Plus-StrangSLAMF7LY9: 160.796.071–160.828.601, Plus-StrangLY9CD244: 160.829.075–160.862.904, Minus-StrangCD244ITLN1: 160.876.539–160.893.012, Minus-StrangITLN1ITLN2: 160.944.266–160.954.889, Minus-StrangITLN2F11R: 160.985.714–161.023.123, Minus-StrangF11R: 160.997.957–161.038.962, Minus-StrangTSTD1: 161.037.619–161.039.118, Minus-StrangTSTD1USF1: 161.039.249–161.045.982, Minus-StrangUSF1ARHGAP30: 161.046.944–161.069.970, Minus-StrangNECTIN4: 161.070.988–161.090.045, Minus-StrangNECTIN4KLHDC9: 161.098.343–161.100.346, Plus-StrangKLHDC9PFDN2: 161.100.556–161.118.070, Minus-StrangPFDN2NIT1: 161.118.082–161.125.812, Plus-StrangNIT1DEDD: 161.120.957–161.133.280, Minus-StrangUFC1: 161.152.776–161.159.368, Plus-StrangUFC1USP21: 161.159.450–161.165.723, Plus-StrangUSP21PPOX: 161.165.837–161.178.576, Plus-StrangPPOXB4GALT3: 161.171.304–161.178.652, Minus-StrangADAMTS4: 161.184.302–161.200.509, Minus-StrangDiagramm von CD48: 4 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 1Exon 4: 160.678.746–160.679.131, 386 BasenExon 3: 160.681.202–160.681.468, 267 BasenExon 2: 160.684.887–160.685.189, 303 BasenExon 1: 160.711.682–160.711.822, 141 Basen43215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,1 kb der 33,1 kb des Gens aus; 732 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von CD48

0Leicht

Wie schwer sich CD48 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Fast alle Exons von CD48 liegen in Bereichen, die Short Reads sauber abbilden.

Dazu kommt der Anteil der Exons von CD48 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Wiederholungen0 %
  • GC-Gehalt0 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). CD48-Gen: CD48 molecule. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/cd48

Vancouver

Dante Labs. CD48-Gen: CD48 molecule [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/cd48

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