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Gen

DEDD

death effector domain containing

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
1q23.3
Koordinaten
Chromosom 1: 161.120.974–161.132.667 (GRCh38)
Exons
6 Exons über 11,7 kb
Protein
318 Aminosäuren
Auch bekannt als
DEFT, FLDED1, CASP8IP1, KE05, DEDD1
MANE-Select-Transkript
ENST00000368006.8NM_032998.3
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet DEDD bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von DEDD

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 1, mit einer Klammer, an der DEDD liegt. DEDD und 36 Gene in der Nähe auf Chromosom 1, von 160.626.821 bis 161.626.820.Chromosom 11q23.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44160,8 Mb161 Mb161,2 Mb161,4 Mb161,6 MbSLAMF1: 160.608.100–160.647.056, Minus-StrangSLAMF1CD48: 160.678.746–160.711.831, Minus-StrangCD48SLAMF7: 160.739.057–160.754.821, Plus-StrangSLAMF7LY9: 160.796.071–160.828.601, Plus-StrangLY9CD244: 160.829.075–160.862.904, Minus-StrangCD244ITLN1: 160.876.539–160.893.012, Minus-StrangITLN1ITLN2: 160.944.266–160.954.889, Minus-StrangITLN2F11R: 160.985.714–161.023.123, Minus-Strang: 160.997.957–161.038.962, Minus-StrangTSTD1: 161.037.619–161.039.118, Minus-StrangTSTD1USF1: 161.039.249–161.045.982, Minus-StrangUSF1ARHGAP30: 161.046.944–161.069.970, Minus-StrangARHGAP30NECTIN4: 161.070.988–161.090.045, Minus-StrangKLHDC9: 161.098.343–161.100.346, Plus-StrangKLHDC9PFDN2: 161.100.556–161.118.070, Minus-StrangPFDN2NIT1: 161.118.082–161.125.812, Plus-StrangNIT1DEDD: 161.120.974–161.132.667, Minus-StrangDEDDUFC1: 161.152.776–161.159.368, Plus-StrangUFC1USP21: 161.159.450–161.165.723, Plus-StrangUSP21PPOX: 161.165.837–161.178.576, Plus-StrangPPOXB4GALT3: 161.171.304–161.178.652, Minus-StrangADAMTS4: 161.184.302–161.200.509, Minus-StrangNDUFS2: 161.197.104–161.214.723, Plus-StrangFCER1G: 161.215.175–161.220.709, Plus-StrangFCER1GAPOA2: 161.222.290–161.227.266, Minus-StrangAPOA2TOMM40L: 161.225.939–161.233.755, Plus-StrangNR1I3: 161.228.775–161.238.276, Minus-StrangNR1I3PCP4L1: 161.258.136–161.285.450, Plus-StrangPCP4L1MPZ: 161.304.735–161.309.974, Minus-StrangMPZSDHC: 161.314.352–161.363.774, Plus-StrangSDHCCFAP126: 161.364.733–161.367.885, Minus-StrangCFAP126FCGR2A: 161.505.415–161.524.013, Plus-StrangFCGR2AHSPA6: 161.524.540–161.526.894, Plus-StrangHSPA6FCGR3A: 161.541.738–161.550.968, Minus-StrangFCGR3A: 161.544.807–161.631.456, Minus-StrangFCGR2C: 161.581.339–161.605.662, Plus-StrangFCGR2CFCGR3B: 161.623.193–161.631.963, Minus-StrangFCGR3BDiagramm von DEDD: 6 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 1Exon 6: 161.120.974–161.122.523, 1.550 BasenExon 5: 161.123.075–161.123.221, 147 BasenExon 4: 161.123.839–161.123.946, 108 BasenExon 3: 161.124.138–161.124.526, 389 BasenExon 2: 161.130.815–161.130.847, 33 BasenExon 1: 161.132.551–161.132.667, 117 Basen6543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 2,3 kb der 11,7 kb des Gens aus; 957 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von DEDD

1Leicht

Wie schwer sich DEDD mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Fast alle Exons von DEDD liegen in Bereichen, die Short Reads sauber abbilden.

Dazu kommt der Anteil der Exons von DEDD in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Wiederholungen5,6 %
  • GC-Gehalt5 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). DEDD-Gen: death effector domain containing. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/dedd

Vancouver

Dante Labs. DEDD-Gen: death effector domain containing [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/dedd

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