Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

PCAT7

prostate cancer associated transcript 7

Shrnutí

Cytogenetická poloha
9q22.32
Souřadnice
Chromozom 9: 94 555 083–94 570 937 (GRCh38)
Exony
3 exonů na 15,9 kb
Další názvy
PCAN-R2
Transkript MANE Select
ENST00000644721.3NR_121567.3
Typ lokusu
Dlouhá nekódující RNA (lncRNA)

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen PCAT7. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je PCAT7 uspořádán

  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 9, se závorkou u PCAT7. PCAT7 a 7 genů poblíž na chromozomu 9, od 94 063 010 do 95 063 009.Chromozom 99q22.32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.394,2 Mb94,4 Mb94,6 Mb94,8 Mb95 MbPTPDC1: 94 030 794–94 109 856, řetězec dopřednémPTPDC1ZNF169: 94 259 280–94 324 660, řetězec dopřednémZNF169NUTM2F: 94 318 198–94 328 644, řetězec zpětnémNUTM2FSLC71A2: 94 374 403–94 461 042, řetězec dopřednémSLC71A2PCAT7: 94 555 083–94 570 937, řetězec dopřednémPCAT7FBP2: 94 558 720–94 593 860, řetězec zpětnémFBP2FBP1: 94 601 143–94 640 323, řetězec zpětnémFBP1AOPEP: 94 726 604–95 151 793, řetězec dopřednémAOPEPSchéma PCAT7: 3 exonů na dopředném řetězci chromozomu 9Exon 1: 94 555 083–94 555 345, 263 bázíExon 2: 94 558 969–94 559 152, 184 bázíExon 3: 94 567 390–94 570 937, 3 548 bází1235′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 4 kb z 15,9 kb genu.

Sekvenování PCAT7

4Snadné

Jak obtížně se PCAT7 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu PCAT7 leží tam, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu PCAT7 v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost1,8 %
  • Homologie0 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice8,3 %
  • Obsah GC0 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PCAT7: prostate cancer associated transcript 7. Staženo 20. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pcat7

Vancouver

Dante Labs. Gen PCAT7: prostate cancer associated transcript 7 [Internet]. [citováno 20. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pcat7

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test