Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

PCAT7

prostate cancer associated transcript 7

Oversigt

Cytogenetisk placering
9q22.32
Koordinater
Kromosom 9: 94.555.083–94.570.937 (GRCh38)
Exoner
3 exoner fordelt over 15,9 kb
Også kendt som
PCAN-R2
MANE Select-transkript
ENST00000644721.3NR_121567.3
Lokustype
Langt ikke-kodende RNA (lncRNA)

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser PCAT7 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er PCAT7 opbygget

  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 9, med en klamme ved PCAT7. PCAT7 og 7 gener i nærheden på kromosom 9, fra 94.063.010 til 95.063.009.Kromosom 99q22.32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.394,2 Mb94,4 Mb94,6 Mb94,8 Mb95 MbPTPDC1: 94.030.794–94.109.856, fremadrettet-strengPTPDC1ZNF169: 94.259.280–94.324.660, fremadrettet-strengZNF169NUTM2F: 94.318.198–94.328.644, omvendt-strengNUTM2FSLC71A2: 94.374.403–94.461.042, fremadrettet-strengSLC71A2PCAT7: 94.555.083–94.570.937, fremadrettet-strengPCAT7FBP2: 94.558.720–94.593.860, omvendt-strengFBP2FBP1: 94.601.143–94.640.323, omvendt-strengFBP1AOPEP: 94.726.604–95.151.793, fremadrettet-strengAOPEPDiagram af PCAT7: 3 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 9Exon 1: 94.555.083–94.555.345, 263 baserExon 2: 94.558.969–94.559.152, 184 baserExon 3: 94.567.390–94.570.937, 3.548 baser1235′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 4 kb af genets 15,9 kb.

Sekventering af PCAT7

4Let

Hvor svær PCAT7 er at sekventere med korte reads, ud af 100

Næsten alle eksonerne i PCAT7 ligger, hvor korte reads kan kortlægges uden problemer.

Det der forstærker det: andelen af PCAT7s eksoner i hver type svært område

  • Mappability1,8 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referencedækning0 %
  • Gentagelser8,3 %
  • GC-indhold0 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). PCAT7-genet: prostate cancer associated transcript 7. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/pcat7

Vancouver

Dante Labs. PCAT7-genet: prostate cancer associated transcript 7 [Internet]. [citeret 20. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/pcat7

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test