Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

PCAT7

prostate cancer associated transcript 7

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
9q22.32
Współrzędne
Chromosom 9: 94 555 083–94 570 937 (GRCh38)
Eksony
3 eksonów na odcinku 15,9 kb
Znany również jako
PCAN-R2
Transkrypt MANE Select
ENST00000644721.3NR_121567.3
Typ locus
Długie niekodujące RNA (lncRNA)

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu PCAT7. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu PCAT7

  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 9, z nawiasem wskazującym położenie PCAT7. PCAT7 i 7 genów w pobliżu na chromosomie 9, od 94 063 010 do 95 063 009.Chromosom 99q22.32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.394,2 Mb94,4 Mb94,6 Mb94,8 Mb95 MbPTPDC1: 94 030 794–94 109 856, nić dodatniejPTPDC1ZNF169: 94 259 280–94 324 660, nić dodatniejZNF169NUTM2F: 94 318 198–94 328 644, nić ujemnejNUTM2FSLC71A2: 94 374 403–94 461 042, nić dodatniejSLC71A2PCAT7: 94 555 083–94 570 937, nić dodatniejPCAT7FBP2: 94 558 720–94 593 860, nić ujemnejFBP2FBP1: 94 601 143–94 640 323, nić ujemnejFBP1AOPEP: 94 726 604–95 151 793, nić dodatniejAOPEPSchemat PCAT7: 3 eksonów na nici dodatniej chromosomu 9Ekson 1: 94 555 083–94 555 345, 263 zasadEkson 2: 94 558 969–94 559 152, 184 zasadEkson 3: 94 567 390–94 570 937, 3548 zasad1235′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 4 kb z 15,9 kb genu.

Sekwencjonowanie PCAT7

4Łatwo

Jak trudno zsekwencjonować PCAT7 krótkimi odczytami, w skali do 100

Niemal wszystkie eksony PCAT7 znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.

Co na to wpływa: udział eksonów PCAT7 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność1,8%
  • Homologia0%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia8,3%
  • Zawartość GC0%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PCAT7: prostate cancer associated transcript 7. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/pcat7

Vancouver

Dante Labs. Gen PCAT7: prostate cancer associated transcript 7 [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/pcat7

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test