Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

PCAT7

prostate cancer associated transcript 7

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
9q22.32
Koordinater
Kromosom 9: 94 555 083–94 570 937 (GRCh38)
Eksoner
3 eksoner over 15,9 kb
Også kjent som
PCAN-R2
MANE Select-transkripsjon
ENST00000644721.3NR_121567.3
Lokustype
Langt ikke-kodende RNA (lncRNA)

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser PCAT7 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er PCAT7 bygget opp

  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 9, med en parentes der PCAT7 står. PCAT7 og 7 gener i nærheten på kromosom 9, fra 94 063 010 til 95 063 009.Kromosom 99q22.32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.394,2 Mb94,4 Mb94,6 Mb94,8 Mb95 MbPTPDC1: 94 030 794–94 109 856, fremover-strengPTPDC1ZNF169: 94 259 280–94 324 660, fremover-strengZNF169NUTM2F: 94 318 198–94 328 644, bakover-strengNUTM2FSLC71A2: 94 374 403–94 461 042, fremover-strengSLC71A2PCAT7: 94 555 083–94 570 937, fremover-strengPCAT7FBP2: 94 558 720–94 593 860, bakover-strengFBP2FBP1: 94 601 143–94 640 323, bakover-strengFBP1AOPEP: 94 726 604–95 151 793, fremover-strengAOPEPDiagram av PCAT7: 3 eksoner på fremover-strengen til kromosom 9Ekson 1: 94 555 083–94 555 345, 263 baserEkson 2: 94 558 969–94 559 152, 184 baserEkson 3: 94 567 390–94 570 937, 3 548 baser1235′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 4 kb av genets 15,9 kb.

Sekvensering av PCAT7

4Lett

Hvor vanskelig PCAT7 er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til PCAT7 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til PCAT7 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet1,8 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner8,3 %
  • GC-innhold0 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). PCAT7-genet: prostate cancer associated transcript 7. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pcat7

Vancouver

Dante Labs. PCAT7-genet: prostate cancer associated transcript 7 [Internett]. [sitert 20. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pcat7

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test