Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PCAT7

prostate cancer associated transcript 7

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9q22.32
Koordináták
9. kromoszóma: 94 555 083–94 570 937 (GRCh38)
Exonok
3 exon, összesen 15,9 kb
Más néven ismert
PCAN-R2
MANE Select transzkriptum
ENST00000644721.3NR_121567.3
Lokusz típusa
Hosszú nem kódoló RNS (lncRNS)

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PCAT7 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PCAT7 felépítése

  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a PCAT7 helyét zárójel jelöli. A PCAT7 és környékén 7 gén a 9. kromoszómán, 94 063 010–95 063 009 között.9. kromoszóma9q22.32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.394,2 Mb94,4 Mb94,6 Mb94,8 Mb95 MbPTPDC1: 94 030 794–94 109 856, előre szálPTPDC1ZNF169: 94 259 280–94 324 660, előre szálZNF169NUTM2F: 94 318 198–94 328 644, fordított szálNUTM2FSLC71A2: 94 374 403–94 461 042, előre szálSLC71A2PCAT7: 94 555 083–94 570 937, előre szálPCAT7FBP2: 94 558 720–94 593 860, fordított szálFBP2FBP1: 94 601 143–94 640 323, fordított szálFBP1AOPEP: 94 726 604–95 151 793, előre szálAOPEPA PCAT7 ábrája: 3 exon a(z) 9. kromoszóma előre szálán1. exon: 94 555 083–94 555 345, 263 bázis2. exon: 94 558 969–94 559 152, 184 bázis3. exon: 94 567 390–94 570 937, 3548 bázis1235′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 15,9 kb-jából 4 kb-ot tesznek ki.

PCAT7 szekvenálása

4Könnyű

Mennyire nehéz a PCAT7 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PCAT7 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PCAT7 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség1,8%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések8,3%
  • GC-tartalom0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PCAT7 gén: prostate cancer associated transcript 7. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pcat7

Vancouver

Dante Labs. PCAT7 gén: prostate cancer associated transcript 7 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pcat7

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet