İçeriğe atla
HSA veya FSA fonlarınızı kullanın
Genomunuzu dizileyin (yeni sekmede açılır)

Gen

LHX1

LIM homeobox 1

Özet

Sitogenetik konum
17q12
Koordinatlar
Kromozom 17: 36.937.475–36.944.612 (GRCh38)
Eksonlar
7,1 kb boyunca 5 ekson
Protein
406 amino asit
Diğer adları
LIM-1, LIM1
MANE Select transkripti
ENST00000614239.1NM_005568.5
Lokus türü
Protein kodlayan
  • Çok yüksek
  • Yüksek
  • Düşük
  • Çok düşük

Bu gen için derlenmiş ilgili raporlar

Hiçbir Genome Test raporu LHX1 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.

LHX1 geninin yapısı

  • Kodlayan dizi
  • Çevrilmeyen bölge
  • İntron
  • Transkripsiyon yönü
Kromozom 17, LHX1 genin yerini gösteren köşeli parantezle. LHX1 ve yakınındaki 10 gen, kromozom 17 üzerinde, 36.441.044 ile 37.441.043 arasında.Kromozom 1717q12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.336,6 Mb36,8 Mb37 Mb37,2 Mb37,4 MbZNHIT3: 36.486.629–36.499.310, ileri iplikZNHIT3MYO19: 36.495.118–36.545.889, geri iplikMYO19PIGW: 36.534.981–36.542.354, ileri iplikPIGWGGNBP2: 36.544.888–36.589.866, ileri iplikGGNBP2DHRS11: 36.591.782–36.600.809, ileri iplikDHRS11MRM1: 36.601.571–36.621.636, ileri iplikMRM1LHX1: 36.937.475–36.944.612, ileri iplikLHX1AATF: 36.948.925–37.056.874, ileri iplikAATFACACA: 37.084.992–37.406.853, geri iplikACACAC17orf78: 37.375.985–37.392.708, ileri iplikC17orf78TADA2A: 37.406.731–37.479.807, ileri iplikTADA2ALHX1 şeması: kromozom 17 üzerinde ileri yönde 5 eksonEkson 1: 36.937.475–36.938.367, 893 bazEkson 2: 36.940.290–36.940.516, 227 bazEkson 3: 36.940.610–36.940.887, 278 bazEkson 4: 36.942.200–36.942.365, 166 bazEkson 5: 36.942.752–36.944.612, 1.861 baz123455′3′

Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.

Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).

Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.

Ekzonlar genin 7,1 kb uzunluğunun 3,4 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.221 tanesi proteini kodlar.

LHX1 dizilemesi

10Kolay

LHX1 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden

LHX1 geninin eksonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşlendiği yerlerde bulunuyor.

Buna ek olarak: LHX1 geninin eksonlarının her zor bölge türündeki payı

  • Eşlenebilirlik%0
  • Homoloji%0
  • Shared with chrY%0
  • Referans kapsamı%0
  • Tekrarlar%9,1
  • GC içeriği%36

Dante Labs'in kendi araştırmasından elde edilen bir puan; NIST'in Genome in a Bottle haritaları, dizilemesi zor bölgeler üzerine kuruludur.Puanlama yöntemi

LHX1 ile bağlantılı özellikler

Human Phenotype Ontology, LHX1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.

Dış bağlantılar

Bilgilerin kaynağı

  • HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
  • NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
  • NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
  • Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.

Bu sayfayı alıntıla

APA

Dante Labs. (t.y.). LHX1 geni: LIM homeobox 1. Erişim tarihi: 19 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lhx1

Vancouver

Dante Labs. LHX1 geni: LIM homeobox 1 [Internet]. [alıntı tarihi 19 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lhx1

Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.

$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde

Genome Test'imi al