Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

LHX1

LIM homeobox 1

Oversigt

Cytogenetisk placering
17q12
Koordinater
Kromosom 17: 36.937.475–36.944.612 (GRCh38)
Exoner
5 exoner fordelt over 7,1 kb
Protein
406 aminosyrer
Også kendt som
LIM-1, LIM1
MANE Select-transkript
ENST00000614239.1NM_005568.5
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser LHX1 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er LHX1 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
Kromosom 17, med en klamme ved LHX1. LHX1 og 10 gener i nærheden på kromosom 17, fra 36.441.044 til 37.441.043.Kromosom 1717q12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.336,6 Mb36,8 Mb37 Mb37,2 Mb37,4 MbZNHIT3: 36.486.629–36.499.310, fremadrettet-strengZNHIT3MYO19: 36.495.118–36.545.889, omvendt-strengMYO19PIGW: 36.534.981–36.542.354, fremadrettet-strengPIGWGGNBP2: 36.544.888–36.589.866, fremadrettet-strengGGNBP2DHRS11: 36.591.782–36.600.809, fremadrettet-strengDHRS11MRM1: 36.601.571–36.621.636, fremadrettet-strengMRM1LHX1: 36.937.475–36.944.612, fremadrettet-strengLHX1AATF: 36.948.925–37.056.874, fremadrettet-strengAATFACACA: 37.084.992–37.406.853, omvendt-strengACACAC17orf78: 37.375.985–37.392.708, fremadrettet-strengC17orf78TADA2A: 37.406.731–37.479.807, fremadrettet-strengTADA2ADiagram af LHX1: 5 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 17Exon 1: 36.937.475–36.938.367, 893 baserExon 2: 36.940.290–36.940.516, 227 baserExon 3: 36.940.610–36.940.887, 278 baserExon 4: 36.942.200–36.942.365, 166 baserExon 5: 36.942.752–36.944.612, 1.861 baser123455′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 3,4 kb af genets 7,1 kb; 1.221 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af LHX1

5Lav

Hvor svært LHX1 er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100

  • Mappabilitet0 %
  • Homologi0 %
  • Gentagelser9,1 %
  • GC-indhold36 %
  • Referencedækning0 %

Træk knyttet til LHX1

Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, LHX1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). LHX1-genet: LIM homeobox 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/lhx1

Vancouver

Dante Labs. LHX1-genet: LIM homeobox 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/lhx1

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test