Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

USHBP1

USH1 protein network component harmonin binding protein 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
19p13.11
Koordinater
Kromosom 19: 17 249 171–17 264 745 (GRCh38)
Exoner
13 exoner på 15,6 kb
Protein
703 aminosyror
Även känd som
MCC2, AIEBP, FLJ38709
MANE Select-transkript
ENST00000252597.8NM_031941.4
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser USHBP1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är USHBP1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 19, med en parentes där USHBP1 finns. USHBP1 och 32 gener i närheten på kromosom 19, från 16 756 958 till 17 756 957.Kromosom 1919p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4316,8 Mb17 Mb17,2 Mb17,4 Mb17,6 MbNWD1: 16 719 847–16 817 963, framåt-strängNWD1SIN3B: 16 829 387–16 880 355, framåt-strängSIN3BF2RL3: 16 888 844–16 892 606, framåt-strängF2RL3CPAMD8: 16 892 951–17 026 982, bakåt-strängCPAMD8HAUS8: 17 049 729–17 075 625, bakåt-strängHAUS8MYO9B: 17 075 728–17 214 537, framåt-strängMYO9BUSE1: 17 215 337–17 220 245, framåt-strängUSE1OCEL1: 17 226 198–17 229 219, framåt-strängNR2F6: 17 229 207–17 245 953, bakåt-strängNR2F6: 17 235 940–17 255 448, bakåt-strängUSHBP1: 17 249 171–17 264 745, bakåt-strängUSHBP1BABAM1: 17 267 343–17 281 249, framåt-strängBABAM1: 17 267 418–17 282 966, framåt-strängANKLE1: 17 281 645–17 287 649, framåt-strängABHD8: 17 292 131–17 310 236, bakåt-strängMRPL34: 17 292 543–17 306 847, framåt-strängDDA1: 17 309 518–17 323 315, framåt-strängDDA1ANO8: 17 323 223–17 334 864, bakåt-strängANO8GTPBP3: 17 334 920–17 342 735, framåt-strängPLVAP: 17 351 450–17 377 356, bakåt-strängPLVAPCCDC194: 17 387 196–17 394 201, bakåt-strängCCDC194BST2: 17 402 933–17 407 393, bakåt-strängBST2MVB12A: 17 405 722–17 436 364, framåt-strängMVB12ATMEM221: 17 435 509–17 448 679, bakåt-strängTMEM221: 17 436 611–17 460 804, bakåt-strängNXNL1: 17 455 425–17 460 926, bakåt-strängNXNL1SLC27A1: 17 467 666–17 506 190, framåt-strängSLC27A1PGLS: 17 511 607–17 521 288, framåt-strängPGLSNIBAN3: 17 523 301–17 553 839, framåt-strängNIBAN3COLGALT1: 17 555 590–17 583 162, framåt-strängCOLGALT1UNC13A: 17 601 327–17 688 382, bakåt-strängUNC13AMAP1S: 17 719 242–17 734 515, framåt-strängMAP1SFCHO1: 17 747 701–17 788 572, framåt-strängFCHO1Diagram över USHBP1: 13 exoner på bakåt-strängen av kromosom 19Exon 13: 17 249 171–17 250 414, 1 244 baserExon 12: 17 251 582–17 251 704, 123 baserExon 11: 17 251 911–17 252 017, 107 baserExon 10: 17 255 385–17 255 606, 222 baserExon 9: 17 256 471–17 256 720, 250 baserExon 8: 17 258 212–17 258 385, 174 baserExon 7: 17 259 289–17 259 429, 141 baserExon 6: 17 259 596–17 259 732, 137 baserExon 5: 17 259 897–17 260 022, 126 baserExon 4: 17 262 552–17 262 990, 439 baserExon 3: 17 264 002–17 264 150, 149 baserExon 2: 17 264 246–17 264 347, 102 baserExon 1: 17 264 671–17 264 745, 75 baser131210864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 3,3 kb av genens 15,6 kb, och 2 112 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av USHBP1

4Lätt

Hur svår USHBP1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Almost all of USHBP1's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of USHBP1's exons in each kind of hard region

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Repetitioner3,3 %
  • GC-innehåll31 %
  • Referenstäckning0 %

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). USHBP1-genen: USH1 protein network component harmonin binding protein 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ushbp1

Vancouver

Dante Labs. USHBP1-genen: USH1 protein network component harmonin binding protein 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ushbp1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test