Gen
U2AF1
U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1
- HGNC 12453↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000160201↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 7307↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 21q22.3
- Koordinater
- Kromosom 21: 43 092 956–43 107 570 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner på 14,6 kb
- Protein
- 240 aminosyror
- Även känd som
- U2AF35, RNU2AF1, RN
- Tidigare symboler
- U2AFBP
- MANE Select-transkript
- ENST00000291552.9NM_006758.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/u2af1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs U2AF1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser U2AF1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är U2AF1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 0,9 kb av genens 14,6 kb, och 723 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av U2AF1
70Hög
Hur svår U2AF1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av U2AF1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.100 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.100 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.20 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.18 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). U2AF1-genen: U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/u2af1
Dante Labs. U2AF1-genen: U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/u2af1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor