Gen
TAF1A
TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A
- HGNC 11532↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000143498↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 9015↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1q41
- Koordinater
- Kromosom 1: 222 558 312–222 589 933 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner på 31,6 kb
- Protein
- 450 aminosyror
- Även känd som
- TAFI48, SL1
- MANE Select-transkript
- ENST00000352967.9NM_005681.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/taf1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs TAF1A, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser TAF1A ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är TAF1A uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,9 kb av genens 31,6 kb, och 1 353 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av TAF1A
0Låg
Hur svår TAF1A är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av TAF1As exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.1,1 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.2,6 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Egenskaper kopplade till TAF1A
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som TAF1A kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). TAF1A-genen: TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/taf1a
Dante Labs. TAF1A-genen: TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/taf1a
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor